17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1627 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1627  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  430  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  43.6 
 
 
654 aa  111  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2429  hypothetical protein  33.78 
 
 
587 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.505611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0356  hypothetical protein  80 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0383  hypothetical protein  91.67 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1786  hypothetical protein  88 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0379  hypothetical protein  40.74 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2427  hypothetical protein  27.18 
 
 
231 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0532981  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1790  hypothetical protein  80 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.844563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4938  hypothetical protein  56.76 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  28.39 
 
 
539 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3047  hypothetical protein  34.25 
 
 
986 aa  45.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.845635  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0393  hypothetical protein  31.62 
 
 
168 aa  43.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978889  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  27.6 
 
 
542 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  29.37 
 
 
558 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0163  hypothetical protein  26.25 
 
 
287 aa  42.4  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0783  hypothetical protein  44.12 
 
 
243 aa  41.6  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.584384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>