11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0379 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0379  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1786  hypothetical protein  36.36 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0167  hypothetical protein  36 
 
 		 239 aa  85.5  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0356  hypothetical protein  70.97 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0383  hypothetical protein  31.53 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1627  hypothetical protein  40.74 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4938  hypothetical protein  73.08 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1790  hypothetical protein  54.55 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.844563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2473  hypothetical protein  30.61 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00962201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  38.24 
 
 		 957 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1185  hypothetical protein  54.55 
 
 		 256 aa  45.4  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>