10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1790 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1790  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.844563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1185  hypothetical protein  39.3 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1786  hypothetical protein  60.61 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0356  hypothetical protein  76 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1627  hypothetical protein  80 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0379  hypothetical protein  54.55 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0383  hypothetical protein  72 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4008  hypothetical protein  25.94 
 
 		 223 aa  45.1  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4938  hypothetical protein  66.67 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0211  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.180901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>