13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0356 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0356  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4419  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.41 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0383  hypothetical protein  31.19 
 
 
205 aa  58.5  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1627  hypothetical protein  80 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0379  hypothetical protein  70.97 
 
 
205 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1786  hypothetical protein  81.48 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4938  hypothetical protein  50 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1790  hypothetical protein  76 
 
 
224 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.844563  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4015  hypothetical protein  27.06 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1185  hypothetical protein  43.48 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4111  hypothetical protein  25.88 
 
 
239 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239231  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2180  hypothetical protein  24.14 
 
 
242 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0437  S-adenosylmethionine synthetase  44.9 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>