74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4607 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  495  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  41.18 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  40 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  37.95 
 
 		 228 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  47.33 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  34.63 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  32.11 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  41.44 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  30.26 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  42.06 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  39.8 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  36.04 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  40.19 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  40.19 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  27.11 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  36.89 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  37.23 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  30.82 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  34.85 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  29.53 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  25.93 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  31.2 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  31.2 
 
 		 242 aa  62  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  34.55 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  36.96 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  36.96 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  31.48 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  30.83 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  37.76 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  41.38 
 
 		 326 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  35.53 
 
 		 279 aa  48.9  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  38.55 
 
 		 327 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  33.33 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  36.78 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  38.57 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  31.58 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  37.93 
 
 		 327 aa  45.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  28.87 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18070  Ion channel  33.71 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00210304  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  44.23 
 
 		 290 aa  45.8  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0496  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 134 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  31.82 
 
 		 289 aa  45.4  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  27.91 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  29.59 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  28.87 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.99 
 
 		 409 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  23.53 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  28.74 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  38.89 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  29.17 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  26.09 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  40.32 
 
 		 149 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  27.84 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  22.76 
 
 		 419 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  29.17 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  24.76 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  30 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  26.67 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  25.29 
 
 		 299 aa  42.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  26.97 
 
 		 294 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  30 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  30 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  30 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  30 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  29.51 
 
 		 405 aa  42.7  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  24.32 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  31.17 
 
 		 273 aa  42  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  35.19 
 
 		 276 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1362  Ion transport 2 domain protein  29.89 
 
 		 134 aa  42  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0402  Ion transport, K+ channel  36.14 
 
 		 113 aa  42  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.234978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  22.97 
 
 		 316 aa  42  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>