More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1366 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  63.95 
 
 		 530 aa  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  63.95 
 
 		 530 aa  702    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  63.57 
 
 		 531 aa  698    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1013  ABC transporter ATP-binding protein  81.12 
 
 		 522 aa  887    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0218  ABC transporter, ATP-binding protein  77.46 
 
 		 525 aa  857    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.307752  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  62.43 
 
 		 530 aa  694    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0990  ABC transporter ATP-binding protein  63.76 
 
 		 531 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  61.86 
 
 		 528 aa  684    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1386  ABC transporter, ATP-binding protein  63.95 
 
 		 531 aa  708    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.65535  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2753  ABC transporter related  63.38 
 
 		 530 aa  696    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  61.86 
 
 		 528 aa  682    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  61.86 
 
 		 528 aa  684    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0127  ABC transporter, ATP-binding protein  60.53 
 
 		 546 aa  667    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1453  ABC transporter ATP-binding protein  58.29 
 
 		 540 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657517  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  63.95 
 
 		 530 aa  702    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1366  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 534 aa  1107    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3204  ABC transporter, ATP-binding protein  63.4 
 
 		 530 aa  696    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.305557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0877  ABC transporter, ATP-binding protein  63.95 
 
 		 530 aa  702    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1839  ABC transporter related  85.77 
 
 		 536 aa  953    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645779  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0945  ABC transporter, ATP-binding protein  59.96 
 
 		 530 aa  657    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1690  ABC transporter, ATP-binding protein  63.95 
 
 		 530 aa  702    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2525  ABC transporter, ATP-binding protein  85.17 
 
 		 533 aa  947    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3190  ABC transporter related  62.43 
 
 		 531 aa  693    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2766  ABC transporter, ATP-binding protein  61.27 
 
 		 521 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0491169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2122  ABC transporter related  84.89 
 
 		 536 aa  930    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.282545  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0878  ABC transporter, ATP-binding protein  63.95 
 
 		 530 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.720445  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  62.62 
 
 		 530 aa  695    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0906  ABC transporter ATP-binding protein  63.95 
 
 		 530 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.753314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0969  ABC transporter ATP-binding protein  63.95 
 
 		 531 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28710  ABC transporter, ATP binding component  63.58 
 
 		 521 aa  682    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  60.91 
 
 		 529 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2108  ABC transporter related  84.89 
 
 		 536 aa  930    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.020355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0911  ABC transporter ATP-binding protein  60.12 
 
 		 523 aa  645    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1844  ABC transporter related  58.1 
 
 		 540 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06614  hypothetical protein  79.12 
 
 		 526 aa  874    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1398  ABC transporter related  58.66 
 
 		 540 aa  647    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.677597  normal  0.0543543 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1311  ABC transporter related  63.19 
 
 		 531 aa  697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  62.62 
 
 		 528 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0936  ABC transporter ATP-binding protein  63.76 
 
 		 530 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  61.67 
 
 		 528 aa  682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00804  hypothetical protein  63.95 
 
 		 530 aa  702    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2760  ABC transporter related  63.38 
 
 		 546 aa  696    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.120146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1676  ABC transporter-related protein  63.57 
 
 		 531 aa  707    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.762171  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1127  ABC transporter, ATP-binding protein  64.71 
 
 		 530 aa  698    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1517  ABC transporter related protein  62.62 
 
 		 530 aa  689    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  59.96 
 
 		 530 aa  657    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1606  ABC transporter related  60.76 
 
 		 528 aa  671    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1506  ABC transporter related  63.01 
 
 		 522 aa  682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1333  ABC transporter related  58.1 
 
 		 560 aa  641    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858749  normal  0.306045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1486  ABC transporter-related protein  62.62 
 
 		 524 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003501  ABC transporter ATP-binding protein  63.38 
 
 		 530 aa  686    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  61.21 
 
 		 557 aa  676    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3260  ABC transporter ATP-binding protein, two fused  63.01 
 
 		 523 aa  689    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0410854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1409  ABC transporter related  64.33 
 
 		 546 aa  704    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0180506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1545  ABC transporter-related protein  62.24 
 
 		 522 aa  674    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1500  ABC transporter related  63.39 
 
 		 522 aa  686    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02269  hypothetical protein  63.95 
 
 		 530 aa  690    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1559  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  69.45 
 
 		 531 aa  778    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2237  ABC transporter related  84.7 
 
 		 536 aa  929    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1135  ABC transporter related  58.98 
 
 		 531 aa  641    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.521044  normal  0.0732961 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2845  ABC transporter related  63.39 
 
 		 522 aa  686    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1961  ABC transporter related  84.64 
 
 		 534 aa  941    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2240  ABC transporter related  63.2 
 
 		 522 aa  689    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3311  ABC transporter related  74.76 
 
 		 527 aa  837    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.819079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  61.67 
 
 		 529 aa  669    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  63.38 
 
 		 531 aa  697    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1575  ABC transporter-related protein  57.17 
 
 		 540 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.830365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2209  ABC transporter related  83.78 
 
 		 530 aa  934    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2115  ABC transporter ATPase  77.8 
 
 		 549 aa  892    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.199216  normal  0.196946 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2288  ABC transporter related  78.53 
 
 		 536 aa  890    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  62.24 
 
 		 528 aa  671    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1712  ABC transporter related  61.97 
 
 		 520 aa  689    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4180  ABC transporter related  74.16 
 
 		 534 aa  840    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0101186  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03121  ABC transporter ATP-binding protein  70.23 
 
 		 530 aa  786    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  62.62 
 
 		 529 aa  682    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  63.95 
 
 		 530 aa  702    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1536  ABC transporter related  63.57 
 
 		 530 aa  698    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2771  ABC transporter related  62.62 
 
 		 522 aa  679    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  63.76 
 
 		 530 aa  701    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2084  ABC transporter related  83.78 
 
 		 530 aa  934    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2586  ABC transporter related  63.38 
 
 		 546 aa  696    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.109376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1891  ABC transporter related  83.78 
 
 		 530 aa  934    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2653  ABC transporter related  63.76 
 
 		 546 aa  699    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.498071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1349  ABC transporter related  63.39 
 
 		 522 aa  691    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2077  ABC transporter related  83.24 
 
 		 553 aa  925    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  63.95 
 
 		 530 aa  702    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39130  putative ATP-binding component of ABC transporter  62.81 
 
 		 521 aa  672    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2999  ABC transporter ATP-binding protein  63.38 
 
 		 587 aa  695    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000839463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  63.76 
 
 		 528 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2173  ABC transporter related  61.24 
 
 		 520 aa  672    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453186  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2370  ABC transporter related  79.29 
 
 		 536 aa  899    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2353  ABC transporter related  84.51 
 
 		 536 aa  927    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.524444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  63.95 
 
 		 530 aa  702    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2150  ABC transporter ATPase  58.3 
 
 		 599 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911921  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0151  ABC transporter, ATP-binding protein  57.12 
 
 		 530 aa  625  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.175992  normal  0.980614 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1795  ABC transporter related  58.3 
 
 		 530 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348279 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2269  ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 530 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1770  ABC transporter related  58.3 
 
 		 530 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210956  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6309  ABC transporter related  58.3 
 
 		 530 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1709  ABC transporter related  58.3 
 
 		 530 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>