295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1210 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  100 
 
 
319 aa  652    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  70.19 
 
 
323 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  70.19 
 
 
323 aa  478  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  70.19 
 
 
323 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  70.19 
 
 
323 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  70.19 
 
 
323 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  70.19 
 
 
323 aa  477  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  69.88 
 
 
323 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  70.19 
 
 
323 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  69.88 
 
 
323 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  69.88 
 
 
323 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  70.19 
 
 
323 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  69.25 
 
 
323 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  68.63 
 
 
323 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  69.25 
 
 
323 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  67.08 
 
 
323 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  68.63 
 
 
323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4417  phosphate binding protein  69.16 
 
 
322 aa  461  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  71.48 
 
 
323 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  71.14 
 
 
323 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  70.27 
 
 
322 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2399  phosphate binding protein  65.85 
 
 
332 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.427135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  69.02 
 
 
332 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  69.02 
 
 
333 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  69.7 
 
 
332 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  68.69 
 
 
332 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  68.35 
 
 
332 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  62.85 
 
 
332 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48600  Phosphate-binding protein PstS  70.61 
 
 
322 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0544  phosphate binding protein  70.63 
 
 
322 aa  429  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  62.85 
 
 
332 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  59.01 
 
 
323 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0096  phosphate binding protein  61.95 
 
 
321 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  58.1 
 
 
319 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01028  hypothetical protein  58.86 
 
 
321 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0957  phosphate binding protein  61.95 
 
 
324 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.086307  normal  0.163139 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  59.02 
 
 
325 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2455  hypothetical protein  57.91 
 
 
329 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1113  phosphate binding protein  60.27 
 
 
319 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.847548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  56.92 
 
 
321 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  56.88 
 
 
321 aa  364  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3274  phosphate binding protein  60.92 
 
 
354 aa  362  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3284  phosphate binding protein  60.92 
 
 
354 aa  362  6e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0271757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3134  phosphate-binding protein  60.92 
 
 
348 aa  362  7.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1010  phosphate binding protein  57.04 
 
 
312 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3300  phosphate binding protein  56.69 
 
 
312 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0655  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  55.35 
 
 
333 aa  344  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.952816  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03438  putative phosphate ABC transporter  52.74 
 
 
316 aa  336  2.9999999999999997e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.72664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1043  phosphate binding protein  59.15 
 
 
312 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  51.9 
 
 
320 aa  332  6e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3104  phosphate binding protein  57.19 
 
 
324 aa  332  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2913  phosphate binding protein  55.44 
 
 
311 aa  320  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3268  phosphate binding protein  44.91 
 
 
330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.889504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  34.59 
 
 
270 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  31.56 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  32.45 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  30.35 
 
 
285 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  33.09 
 
 
272 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  33.21 
 
 
272 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  33.09 
 
 
272 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  32.08 
 
 
268 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  31.8 
 
 
302 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  31.84 
 
 
284 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  31.82 
 
 
301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0047  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  26.71 
 
 
269 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134705  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  29.28 
 
 
274 aa  116  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  30.04 
 
 
274 aa  116  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  31 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  30.86 
 
 
272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  29.28 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  30.26 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  30.68 
 
 
267 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  29.92 
 
 
281 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  29.33 
 
 
279 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  30.4 
 
 
285 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  30.94 
 
 
282 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3266  phosphate-binding protein  28.21 
 
 
307 aa  105  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  27.65 
 
 
278 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  29.37 
 
 
332 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  30.94 
 
 
281 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  28.52 
 
 
381 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  29.37 
 
 
281 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  29.01 
 
 
273 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2101  phosphate binding protein  27.39 
 
 
313 aa  99.8  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  28.62 
 
 
338 aa  99.8  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  28.36 
 
 
272 aa  99  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  27.94 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  24.09 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  28.73 
 
 
273 aa  96.3  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  25.99 
 
 
284 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  27.97 
 
 
264 aa  94.7  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  28.01 
 
 
270 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  28.68 
 
 
287 aa  94  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.66 
 
 
276 aa  93.2  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  30.86 
 
 
464 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  26.52 
 
 
328 aa  92.8  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  27.74 
 
 
281 aa  92.4  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1249  phosphate binding protein  26.87 
 
 
340 aa  92.4  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00301089  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  27.97 
 
 
272 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  30.66 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>