51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2043 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2043  putative UV damage endonuclease  100 
 
 		 412 aa  817    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2329  putative UV damage endonuclease  96.6 
 
 		 412 aa  794    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.385133  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  34.68 
 
 		 420 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.295167 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  33.95 
 
 		 418 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1722  putative UV damage endonuclease  32.56 
 
 		 301 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09690  UV-damage endonuclease  35.57 
 
 		 309 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1671  putative UV damage endonuclease  30.63 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00771336  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0352  putative UV damage endonuclease  33.89 
 
 		 320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  32.34 
 
 		 321 aa  163  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0268  putative UV damage endonuclease  29.08 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0282  putative UV damage endonuclease  28.85 
 
 		 320 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0263  putative UV damage endonuclease  29.41 
 
 		 320 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5061  putative UV damage endonuclease  29.41 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0220  putative UV damage endonuclease  29.08 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0261  putative UV damage endonuclease  29.08 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5482  putative UV damage endonuclease  30.94 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00076695  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0248  putative UV damage endonuclease  30.86 
 
 		 320 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0234  putative UV damage endonuclease  30.86 
 
 		 320 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0226  putative UV damage endonuclease  28.71 
 
 		 320 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0222  putative UV damage endonuclease  28.52 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2026  UV-endonuclease UvdE  31.13 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5145  putative UV damage endonuclease  31.02 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5525  putative UV damage endonuclease  31.15 
 
 		 325 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5470  putative UV damage endonuclease  30.82 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000392021  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03600  conserved hypothetical protein  34.27 
 
 		 612 aa  146  6e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.574638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5478  putative UV damage endonuclease  31.31 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5047  putative UV damage endonuclease  31.15 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.43469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5440  putative UV damage endonuclease  30.26 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5196  putative UV damage endonuclease  30.82 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5031  putative UV damage endonuclease  30.82 
 
 		 317 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5592  putative UV damage endonuclease  30.82 
 
 		 325 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00604  endonuclease (Eurofung)  31.9 
 
 		 591 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2305  UV-endonuclease UvdE  29.61 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2424  UV-endonuclease UvdE  24.65 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0174  putative UV damage endonuclease  28.1 
 
 		 296 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1346  putative UV damage endonuclease  27.8 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4123  putative UV damage endonuclease  27.03 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0136  putative UV damage endonuclease  31.03 
 
 		 225 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1694  UV damage repair endonuclease-like protein  26.89 
 
 		 313 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2319  UV damage repair endonuclease-like protein  27.8 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0573  putative UV damage endonuclease  26.34 
 
 		 315 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280192  normal  0.431721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6817  UV damage repair endonuclease  24.09 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3025  putative UV damage endonuclease  25.41 
 
 		 298 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0383  UV damage repair endonuclease-like protein  26.17 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0127865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1707  UV damage repair endonuclease  25.26 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1536  UV damage repair endonuclease  24.21 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1816  UV damage repair endonuclease  24.21 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1775  hypothetical protein  52.86 
 
 		 57 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000133943  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2133  UV damage repair endonuclease  22.11 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  0.466844 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1819  putative UV damage endonuclease  23.04 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.594158 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3654  UV damage repair endonuclease-like protein  24 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000592118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>