More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0506 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  98.45 
 
 
384 aa  268  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  98.45 
 
 
384 aa  268  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  98.45 
 
 
384 aa  268  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0506  ISCpe2, transposase orfB  100 
 
 
129 aa  267  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  97.67 
 
 
384 aa  267  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  97.67 
 
 
384 aa  267  4e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  98.45 
 
 
384 aa  267  4e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  97.67 
 
 
384 aa  267  5e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  97.67 
 
 
384 aa  266  7e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0472  ISCpe2, transposase orfB  96.9 
 
 
384 aa  266  8.999999999999999e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  96.9 
 
 
384 aa  265  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  97.67 
 
 
383 aa  265  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  97.67 
 
 
384 aa  265  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  96.9 
 
 
384 aa  264  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  95.35 
 
 
384 aa  263  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1049  ISCpe2, transposase orfB  96.9 
 
 
384 aa  263  7e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00154487  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  96.12 
 
 
384 aa  261  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  63.71 
 
 
373 aa  179  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  63.71 
 
 
372 aa  179  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  63.71 
 
 
372 aa  179  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  63.71 
 
 
372 aa  179  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  63.71 
 
 
372 aa  179  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  62.9 
 
 
373 aa  178  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  62.9 
 
 
373 aa  177  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  62.9 
 
 
373 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  62.1 
 
 
373 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  62.1 
 
 
373 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  62.1 
 
 
373 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  62.9 
 
 
383 aa  176  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0404  transposase  61.29 
 
 
259 aa  174  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  60.48 
 
 
383 aa  173  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  62.6 
 
 
370 aa  168  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  58.87 
 
 
383 aa  167  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  61.79 
 
 
370 aa  167  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0042  transposase  57.94 
 
 
362 aa  157  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.580929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2515  transposase, IS605 OrfB family  59.35 
 
 
326 aa  150  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  53.6 
 
 
388 aa  148  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  56.91 
 
 
440 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  53.17 
 
 
410 aa  146  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  54.03 
 
 
375 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  55.56 
 
 
372 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  52.03 
 
 
381 aa  143  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  55.46 
 
 
377 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  53.66 
 
 
391 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  51.22 
 
 
381 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  53.54 
 
 
304 aa  140  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  52.03 
 
 
362 aa  141  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  51.59 
 
 
410 aa  140  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  52 
 
 
405 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  52.38 
 
 
393 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  52.38 
 
 
370 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  53.97 
 
 
403 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  52.85 
 
 
377 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  55.46 
 
 
377 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  52.38 
 
 
370 aa  138  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  50 
 
 
410 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
408 aa  137  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  51.22 
 
 
368 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  50.39 
 
 
370 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  52.38 
 
 
370 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  52.38 
 
 
370 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  52.34 
 
 
403 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  52.34 
 
 
403 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  52.34 
 
 
403 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  49.59 
 
 
381 aa  137  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  52.34 
 
 
403 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  52.94 
 
 
405 aa  137  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  52.34 
 
 
300 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  49.59 
 
 
376 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  52.34 
 
 
393 aa  136  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  51.59 
 
 
370 aa  136  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  51.22 
 
 
403 aa  136  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  51.56 
 
 
403 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  49.21 
 
 
383 aa  135  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  50 
 
 
370 aa  134  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  51.59 
 
 
370 aa  134  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  51.22 
 
 
395 aa  134  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  50 
 
 
373 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  48.78 
 
 
391 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  50 
 
 
370 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  50.39 
 
 
394 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2489  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
256 aa  130  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  48.78 
 
 
391 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  49.6 
 
 
402 aa  130  9e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  49.6 
 
 
402 aa  130  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  49.19 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  49.6 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  48.82 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  48.39 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  49.59 
 
 
390 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  49.19 
 
 
383 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  49.19 
 
 
383 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  49.19 
 
 
383 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  49.19 
 
 
383 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1254  IS605 family transposase OrfB  51.2 
 
 
378 aa  127  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  49.21 
 
 
311 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  47.97 
 
 
383 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>