258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1497 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1497  ATPase domain-containing protein  100 
 
 
945 aa  1915    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0028368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5709  Molecular chaperone HSP90 family-like protein  36.03 
 
 
939 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147781 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3728  HSP90 family molecular chaperone-like protein  35.67 
 
 
958 aa  422  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00163945  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1982  metal dependent phosphohydrolase  24.8 
 
 
814 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0121434  decreased coverage  0.00400168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2572  HSP90 family molecular chaperone-like protein  28.7 
 
 
881 aa  94.4  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4138  ATP-binding region, ATPase-like  23.88 
 
 
887 aa  84.7  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322589  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0853  heat shock protein 90  27.85 
 
 
637 aa  79.3  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.773186  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0237  heat shock protein 90  24.03 
 
 
637 aa  77  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.528413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4377  ATPase domain-containing protein  28.48 
 
 
594 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1548  ATPase domain-containing protein  21.68 
 
 
800 aa  70.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6025  heat shock protein 90  23.5 
 
 
630 aa  70.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2812  heat shock protein 90  25 
 
 
637 aa  68.9  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1277  heat shock protein 90  28.75 
 
 
635 aa  67.4  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318066  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  26.52 
 
 
626 aa  67.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1348  heat shock protein 90  29.61 
 
 
618 aa  67.8  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.323848  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1086  heat shock protein 90  25.93 
 
 
623 aa  66.2  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0546  heat shock protein 90  27.84 
 
 
608 aa  65.5  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.325036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4376  HSP90 family molecular chaperone-like  27.27 
 
 
838 aa  65.1  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3632  heat shock protein 90  23.33 
 
 
638 aa  63.9  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0958  heat shock protein 90  28.65 
 
 
617 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  30.88 
 
 
632 aa  63.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0625  heat shock protein 90  29.71 
 
 
608 aa  62.8  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  28.24 
 
 
629 aa  62.4  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  28.24 
 
 
629 aa  62.4  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4692  heat shock protein 90  29.85 
 
 
628 aa  62.4  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595162  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4929  heat shock protein 90  29.53 
 
 
620 aa  62  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.621243 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1998  heat shock protein 90  29.19 
 
 
666 aa  62  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.154063  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  26.14 
 
 
630 aa  61.6  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1404  heat shock protein 90  24.28 
 
 
634 aa  61.6  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.898305 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  27.91 
 
 
647 aa  61.6  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3368  ATP-binding region, ATPase-like  33.6 
 
 
833 aa  61.6  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76622  hitchhiker  0.00609723 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1997  heat shock protein 90  27.92 
 
 
619 aa  61.6  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  25.37 
 
 
624 aa  61.2  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0703  heat shock protein 90  27.08 
 
 
609 aa  61.2  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1199  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  23.21 
 
 
652 aa  61.2  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1719  heat shock protein 90  28.99 
 
 
656 aa  60.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0570  heat shock protein 90  30.59 
 
 
616 aa  60.8  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  26.47 
 
 
634 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1413  heat shock protein 90  28.99 
 
 
608 aa  60.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.276817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.09 
 
 
2050 aa  61.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15251  heat shock protein 90  24.44 
 
 
636 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  22.94 
 
 
631 aa  60.1  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  27.41 
 
 
636 aa  60.1  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  29.68 
 
 
623 aa  60.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  27.01 
 
 
624 aa  59.7  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  27.49 
 
 
638 aa  60.1  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000064656  unclonable  0.0000000164624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2005  heat shock protein 90  23.34 
 
 
656 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  29.63 
 
 
638 aa  60.1  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  30.08 
 
 
629 aa  60.1  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  26.28 
 
 
624 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  26.28 
 
 
624 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  26.28 
 
 
624 aa  59.7  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1800  heat shock protein Hsp90  27.23 
 
 
646 aa  59.3  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  26.28 
 
 
624 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  26.28 
 
 
624 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  25.29 
 
 
637 aa  58.9  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2849  heat shock protein 90  28.89 
 
 
638 aa  59.3  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000520054  decreased coverage  0.00000000518986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  27.82 
 
 
640 aa  58.9  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  26.28 
 
 
624 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  26.28 
 
 
624 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  26.28 
 
 
624 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5302  heat shock protein 90  27.94 
 
 
628 aa  58.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  26.28 
 
 
624 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  26.28 
 
 
624 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  26.28 
 
 
624 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  26.28 
 
 
624 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  26.28 
 
 
624 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  27.07 
 
 
629 aa  58.5  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1798  heat shock protein 90  26.55 
 
 
637 aa  58.2  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  26.55 
 
 
637 aa  58.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0580  heat shock protein 90  30.37 
 
 
653 aa  58.2  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.360532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  26.55 
 
 
637 aa  58.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2548  heat shock protein 90  26.55 
 
 
637 aa  58.2  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00763476  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1264  heat shock protein 90  27.06 
 
 
630 aa  58.2  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0853768  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4402  heat shock protein 90  29.1 
 
 
628 aa  57.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626215  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0243  heat shock protein 90  22.87 
 
 
650 aa  57.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2338  ATP-binding region ATPase domain protein  28.26 
 
 
638 aa  57.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.268084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  27.41 
 
 
639 aa  57.4  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0956  heat shock protein 90  27.49 
 
 
634 aa  57.4  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.538924  normal  0.713469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3387  heat shock protein 90  23.53 
 
 
643 aa  57.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09791  heat shock protein 90  24.28 
 
 
634 aa  57.4  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.275736 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0306  heat shock protein 90  24.44 
 
 
634 aa  57  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0856617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  24.32 
 
 
651 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  27.48 
 
 
627 aa  56.6  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  26.28 
 
 
624 aa  56.2  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3036  heat shock protein 90  24.82 
 
 
629 aa  57  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  24.71 
 
 
637 aa  55.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  27.82 
 
 
634 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1147  heat shock protein 90  24.3 
 
 
636 aa  56.2  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30595  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  28.19 
 
 
626 aa  56.2  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  26.32 
 
 
623 aa  55.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  29.41 
 
 
634 aa  56.2  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5718  Molecular chaperone HSP90 family-like protein  26.67 
 
 
872 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.903577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4272  heat shock protein 90  26 
 
 
643 aa  56.2  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  25 
 
 
634 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3489  heat shock protein 90  20.5 
 
 
665 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.179421 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_55215  heat shock protein Hsp90  26.26 
 
 
780 aa  55.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5294  heat shock protein 90  24.63 
 
 
636 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117014  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2614  heat shock protein 90  20.5 
 
 
665 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0899  heat shock protein 90  24.04 
 
 
634 aa  55.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.460903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>