260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3368 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3368  ATP-binding region, ATPase-like  100 
 
 		 833 aa  1687    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76622  hitchhiker  0.00609723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4138  ATP-binding region, ATPase-like  34.81 
 
 		 887 aa  348  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1982  metal dependent phosphohydrolase  25.08 
 
 		 814 aa  87.8  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0121434  decreased coverage  0.00400168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2572  HSP90 family molecular chaperone-like protein  24.3 
 
 		 881 aa  83.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1497  ATPase domain-containing protein  35.71 
 
 		 945 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0028368  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.01 
 
 		 2050 aa  68.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103248 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3728  HSP90 family molecular chaperone-like protein  25.2 
 
 		 958 aa  68.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00163945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5709  Molecular chaperone HSP90 family-like protein  29.19 
 
 		 939 aa  64.7  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147781 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0703  heat shock protein 90  29.66 
 
 		 609 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20340  heat shock protein 90  34.68 
 
 		 644 aa  59.7  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  34.11 
 
 		 635 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1831  HSP90 family protein  35.59 
 
 		 646 aa  59.3  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  33.33 
 
 		 637 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2002  heat shock protein 90  30.64 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.240397 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0051  heat shock protein 90  28.57 
 
 		 629 aa  58.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.544882  normal  0.404377 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09581  heat shock protein 90  33.1 
 
 		 634 aa  58.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5199  heat shock protein 90  28.08 
 
 		 610 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661804  normal  0.486638 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  34.88 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  34.88 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  34.88 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  34.88 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  34.88 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  34.88 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  34.88 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  34.88 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09601  heat shock protein 90  33.1 
 
 		 634 aa  57.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.237308  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  34.11 
 
 		 624 aa  57.4  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1147  heat shock protein 90  33.33 
 
 		 636 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30595  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26010  TRAP1, Heat Shock Protein 90  34.38 
 
 		 700 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0886232  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4279  Hsp90xo protein  33.59 
 
 		 608 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  32.06 
 
 		 626 aa  57  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  34.88 
 
 		 624 aa  56.2  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  36.44 
 
 		 624 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1549  heat shock protein 90  32 
 
 		 630 aa  56.2  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678256  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1413  heat shock protein 90  30.51 
 
 		 608 aa  56.6  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.276817  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  36.44 
 
 		 624 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1195  heat shock protein 90  36 
 
 		 628 aa  57  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0899  heat shock protein 90  31.69 
 
 		 634 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.460903  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  36.44 
 
 		 624 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  33.33 
 
 		 626 aa  56.2  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1086  heat shock protein 90  34.96 
 
 		 623 aa  56.6  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  31.75 
 
 		 652 aa  56.2  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  36.44 
 
 		 624 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  36.44 
 
 		 624 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4284  hypothetical protein  32.77 
 
 		 611 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0625  heat shock protein 90  30.51 
 
 		 608 aa  55.8  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  34.69 
 
 		 626 aa  55.8  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3632  heat shock protein 90  32.9 
 
 		 638 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4376  HSP90 family molecular chaperone-like  29.12 
 
 		 838 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4676  heat shock protein 90  37.5 
 
 		 657 aa  55.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0546  heat shock protein 90  30.51 
 
 		 608 aa  55.8  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.325036  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  34.13 
 
 		 622 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  34.13 
 
 		 624 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  34.13 
 
 		 624 aa  55.5  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  34.56 
 
 		 623 aa  55.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12322  heat shock protein 90  34.75 
 
 		 647 aa  55.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1006  heat shock protein 90  30.17 
 
 		 612 aa  55.5  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.511721  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69965  Heat shock protein 90 homolog  31.4 
 
 		 709 aa  55.1  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0615348  normal  0.460781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4402  heat shock protein 90  30.89 
 
 		 628 aa  55.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2812  heat shock protein 90  32.88 
 
 		 637 aa  54.7  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  34.71 
 
 		 627 aa  54.3  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  32.81 
 
 		 635 aa  54.3  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  32.56 
 
 		 628 aa  54.3  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0495  heat shock protein 90  34.78 
 
 		 620 aa  54.3  0.000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4208  ATP-binding region ATPase domain protein  34.75 
 
 		 589 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1022  heat shock protein 90  32.81 
 
 		 629 aa  53.9  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_55215  heat shock protein Hsp90  28.65 
 
 		 780 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  35.43 
 
 		 628 aa  53.9  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  35.43 
 
 		 628 aa  53.9  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4127  heat shock protein 90  29.66 
 
 		 669 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1548  ATPase domain-containing protein  29.8 
 
 		 800 aa  53.9  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0956  heat shock protein 90  34.38 
 
 		 634 aa  53.5  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.538924  normal  0.713469 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  31.06 
 
 		 629 aa  53.9  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09831  heat shock protein 90  32.39 
 
 		 634 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5466  HSP90 family protein  31.36 
 
 		 585 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3901  heat shock protein 90  33.1 
 
 		 653 aa  53.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.795746  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0943  heat shock protein 90  29.25 
 
 		 603 aa  52.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2338  ATP-binding region ATPase domain protein  29.51 
 
 		 638 aa  53.5  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.268084  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  33.85 
 
 		 633 aa  53.5  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  33.85 
 
 		 633 aa  53.5  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  33.62 
 
 		 634 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  31.75 
 
 		 630 aa  53.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1800  heat shock protein Hsp90  28.46 
 
 		 646 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  32.56 
 
 		 634 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_55230  predicted protein  27.01 
 
 		 709 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0570  heat shock protein 90  31.93 
 
 		 616 aa  52.8  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2480  heat shock protein 90  30.77 
 
 		 640 aa  52.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1459  ATP-binding region ATPase domain protein  26.21 
 
 		 610 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1273  heat shock protein 90  33.86 
 
 		 625 aa  52.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1082  heat shock protein 90  30.61 
 
 		 634 aa  52.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1199  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  30.34 
 
 		 652 aa  52.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4692  heat shock protein 90  30.17 
 
 		 628 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0401  heat shock protein 90  28.21 
 
 		 617 aa  52.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0417  heat shock protein 90  31.09 
 
 		 623 aa  52.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0746567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0413  heat shock protein 90  31.09 
 
 		 623 aa  52.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  32.56 
 
 		 634 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15251  heat shock protein 90  29.58 
 
 		 636 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  33.61 
 
 		 633 aa  52  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0580  heat shock protein 90  31.06 
 
 		 653 aa  52.4  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.360532 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0800  heat shock protein 90  33.33 
 
 		 633 aa  52.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>