204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4138 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4138  ATP-binding region, ATPase-like  100 
 
 		 887 aa  1818    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3368  ATP-binding region, ATPase-like  34.53 
 
 		 833 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76622  hitchhiker  0.00609723 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1982  metal dependent phosphohydrolase  25.49 
 
 		 814 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0121434  decreased coverage  0.00400168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2572  HSP90 family molecular chaperone-like protein  22.61 
 
 		 881 aa  88.2  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1497  ATPase domain-containing protein  23.88 
 
 		 945 aa  84.7  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0028368  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3728  HSP90 family molecular chaperone-like protein  24.9 
 
 		 958 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00163945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5709  Molecular chaperone HSP90 family-like protein  31.75 
 
 		 939 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5718  Molecular chaperone HSP90 family-like protein  28.21 
 
 		 872 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.903577 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6025  heat shock protein 90  31.43 
 
 		 630 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26010  TRAP1, Heat Shock Protein 90  30.81 
 
 		 700 aa  60.1  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0886232  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  27.75 
 
 		 626 aa  59.7  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0826  heat shock protein 90  30.23 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4279  Hsp90xo protein  27.96 
 
 		 608 aa  58.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1831  HSP90 family protein  33.33 
 
 		 646 aa  58.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2338  ATP-binding region ATPase domain protein  25.68 
 
 		 638 aa  57.8  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.268084  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0495  heat shock protein 90  31.21 
 
 		 620 aa  57.8  0.0000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1779  ATP-binding region ATPase domain protein  29.82 
 
 		 613 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.46 
 
 		 2050 aa  57.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103248 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4284  hypothetical protein  26.07 
 
 		 611 aa  57  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1086  heat shock protein 90  29.87 
 
 		 623 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2812  heat shock protein 90  30.17 
 
 		 637 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1071  heat shock protein 90  27.75 
 
 		 629 aa  55.8  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2987  ATP-binding region ATPase domain protein  36.3 
 
 		 622 aa  55.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4272  heat shock protein 90  28.02 
 
 		 643 aa  55.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3632  heat shock protein 90  29.21 
 
 		 638 aa  55.5  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3230  heat shock protein 90  23.08 
 
 		 614 aa  55.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  29.89 
 
 		 634 aa  55.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  30.27 
 
 		 634 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  29.89 
 
 		 634 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1573  heat shock protein 90  28.16 
 
 		 628 aa  54.3  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534584  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0899  heat shock protein 90  25.9 
 
 		 634 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.460903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4377  ATPase domain-containing protein  32.56 
 
 		 594 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4673  heat shock protein 90  29.55 
 
 		 631 aa  53.5  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25549  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4208  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 589 aa  53.5  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  28.74 
 
 		 634 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0695  HSP90 family protein  34.21 
 
 		 643 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1147  heat shock protein 90  28.4 
 
 		 636 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2376  heat shock protein 90  27.48 
 
 		 627 aa  52.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1548  ATPase domain-containing protein  32 
 
 		 800 aa  52.8  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19170  heat shock protein 90  30.81 
 
 		 635 aa  52.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000174366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  31.85 
 
 		 611 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  28.74 
 
 		 637 aa  52.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  29.12 
 
 		 635 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  26.97 
 
 		 624 aa  52.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  28.57 
 
 		 633 aa  52.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  26.97 
 
 		 624 aa  52.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  28.81 
 
 		 652 aa  52.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  26.97 
 
 		 622 aa  52  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  27.98 
 
 		 629 aa  52.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09601  heat shock protein 90  24.7 
 
 		 634 aa  52.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.237308  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09581  heat shock protein 90  24.7 
 
 		 634 aa  52.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  28.18 
 
 		 637 aa  52  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0958  heat shock protein 90  29.01 
 
 		 617 aa  52  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08591  heat shock protein 90  26.23 
 
 		 632 aa  51.6  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.559201  hitchhiker  0.00238922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2497  heat shock protein 90  28.49 
 
 		 632 aa  51.2  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.558694  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  30.67 
 
 		 637 aa  51.2  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000323275  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0306  heat shock protein 90  24.86 
 
 		 634 aa  51.2  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0856617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  30 
 
 		 637 aa  51.2  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000082742  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2251  heat shock protein 90  31.85 
 
 		 637 aa  51.2  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000711928  normal  0.266626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2323  heat shock protein 90  31.85 
 
 		 637 aa  51.2  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000423215  hitchhiker  0.000689405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2443  heat shock protein 90  31.85 
 
 		 637 aa  51.2  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000425948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09791  heat shock protein 90  25.41 
 
 		 634 aa  51.2  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.275736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  30 
 
 		 637 aa  51.2  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1910  heat shock protein 90  30.05 
 
 		 650 aa  51.2  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194345 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2548  heat shock protein 90  30 
 
 		 637 aa  51.2  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00763476  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1798  heat shock protein 90  30 
 
 		 637 aa  51.2  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145006 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0266  heat shock protein 90  29.65 
 
 		 636 aa  50.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.48191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004137  chaperone protein HtpG  31.25 
 
 		 634 aa  50.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  28.33 
 
 		 637 aa  50.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09831  heat shock protein 90  24.85 
 
 		 634 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  28.9 
 
 		 623 aa  50.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1472  heat shock protein 90  29.84 
 
 		 615 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0800  heat shock protein 90  29.41 
 
 		 633 aa  50.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0570  heat shock protein 90  28.57 
 
 		 616 aa  50.4  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0853  heat shock protein 90  27.34 
 
 		 637 aa  49.7  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.773186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4976  heat shock protein 90  24.71 
 
 		 678 aa  50.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144438  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  26.74 
 
 		 628 aa  50.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1428  heat shock protein 90  26.45 
 
 		 637 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000680402  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0296  heat shock protein 90  29.65 
 
 		 636 aa  50.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2463  HSP90 family protein  29.05 
 
 		 621 aa  50.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0779682  decreased coverage  0.00689697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0484  heat shock protein 90  26.14 
 
 		 662 aa  50.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5466  HSP90 family protein  28.42 
 
 		 585 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  29.03 
 
 		 635 aa  50.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  27.22 
 
 		 642 aa  50.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  26.82 
 
 		 634 aa  49.3  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1277  heat shock protein 90  29.63 
 
 		 635 aa  49.7  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.318066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  29.11 
 
 		 634 aa  49.7  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  28.26 
 
 		 634 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1188  heat shock protein 90  32.03 
 
 		 626 aa  49.3  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  28 
 
 		 630 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0495  ATP-binding region ATPase domain protein  32.64 
 
 		 598 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  28.26 
 
 		 634 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  29.77 
 
 		 627 aa  48.9  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  27.84 
 
 		 624 aa  48.9  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  30.37 
 
 		 611 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  29.32 
 
 		 610 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2894  heat shock protein 90  27.23 
 
 		 640 aa  49.3  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.511153  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2009  heat shock protein 90  30.2 
 
 		 613 aa  48.9  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00313  heat shock protein 90  27.49 
 
 		 634 aa  48.5  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1538  heat shock protein 90  26.06 
 
 		 637 aa  48.5  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0309955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>