More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0504 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0504  HAD family hydrolase  100 
 
 		 264 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.928419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0492  HAD family hydrolase  98.11 
 
 		 264 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2261  Cof-like hydrolase  32.59 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000564969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.15 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  31.15 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  32.69 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  32.69 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  32.69 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.69 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.69 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.69 
 
 		 257 aa  121  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  30.38 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  30.38 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  32.84 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  29.12 
 
 		 265 aa  115  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  32.37 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0949  Cof-like hydrolase  31.68 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000135628  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0259  Cof-like hydrolase  31.58 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000719541  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0780  hypothetical protein  31.8 
 
 		 462 aa  102  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.680411  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1489  Cof-like hydrolase  29.52 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  29.08 
 
 		 460 aa  98.2  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1822  HAD superfamily hydrolase  29.26 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1689  Cof family protein  29.03 
 
 		 461 aa  95.5  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00487865  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3317  Cof-like hydrolase  27.24 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000026375  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0716  HAD family phosphatase  28.52 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.43 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000018456 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2176  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.62 
 
 		 258 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.685473  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.46 
 
 		 468 aa  92.4  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2067  hydrolase  29.17 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.347224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1927  Cof-like hydrolase  29.37 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107628  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0258  Cof-like hydrolase  31.39 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000345946  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf285  COF family HAD hydrolase protein  29.74 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0114405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1882  HAD superfamily hydrolase  29.23 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3240  hydrolase  28.73 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0554089  normal  0.223166 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1083  Cof-like hydrolase  28.74 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  29.06 
 
 		 271 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1580  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0968  HAD superfamily hydrolase  29.12 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.860573  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  27.34 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.69 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0394  Cof-like hydrolase  28.46 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1892  HAD superfamily hydrolase  27.69 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.03 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2161  Cof-like hydrolase  29.59 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  27.65 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1930  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2077  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.51 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.93 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  27.73 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.94 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2185  Cof-like hydrolase  25.68 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2223  Cof-like hydrolase  25.68 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.48 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  28.31 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1759  HAD-superfamily cof-like hydrolase  25.38 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  28.51 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.51 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  28.51 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  28.51 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  28.51 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  26.61 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  28.51 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.51 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.16 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00143564  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  28.1 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  25.19 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  25.19 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  25.19 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  27.31 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.02 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.62 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.454773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.54 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.81 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000799455  normal  0.0158039 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  27.8 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  28.4 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  25.51 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  28.67 
 
 		 279 aa  72  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  28.21 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  28.52 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.83 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  25.36 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  25.7 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  26.6 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  26.24 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  25.7 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  25.48 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  23.31 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  26.59 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.6 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  26.6 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  26.6 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  23.99 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1895  HAD superfamily hydrolase  27.41 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000132103  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  26.59 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  26.6 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  27.42 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  20.51 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>