31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG01700 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006692  CNG01700  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  374  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05710  MipD, putative  35.29 
 
 		 417 aa  102  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0879968  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53054  3'-5' exonuclease  34.9 
 
 		 271 aa  97.4  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_5546  predicted protein  34.21 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6857  predicted protein  34.76 
 
 		 183 aa  87.4  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261125  normal  0.0907147 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10955  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05560)  32.89 
 
 		 299 aa  86.3  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.606839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_4761  predicted protein  32.24 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000849222  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13309  predicted protein  31.87 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0894911  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8401  predicted protein  34.67 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15565  predicted protein  32.21 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0122539  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5177  predicted protein  27.67 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.617498 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33043  predicted protein  30.07 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804843  normal  0.549748 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07566  exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14950)  30 
 
 		 723 aa  55.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61778  predicted protein  28.99 
 
 		 645 aa  55.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17866  normal  0.0618805 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40875  predicted protein  29.66 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0271597 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00500  3'-5' exonuclease, putative  27.56 
 
 		 532 aa  48.5  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44042  predicted protein  31.08 
 
 		 578 aa  46.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3002  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.57 
 
 		 372 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38270  predicted protein  26.42 
 
 		 583 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02065  PAB-dependent poly(A)-specific ribonuclease subunit pan2 (EC 3.1.13.4)(PAB1P-dependent poly(A)-nuclease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL5]  27.54 
 
 		 1154 aa  45.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04900  conserved hypothetical protein  28.31 
 
 		 1183 aa  44.3  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.427211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1948  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  21.66 
 
 		 184 aa  44.3  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.111386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1982  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  21.66 
 
 		 184 aa  44.3  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04357  RNA exonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00870)  32.12 
 
 		 560 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00340462  normal  0.927116 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42642  predicted protein  34.23 
 
 		 696 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517261  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02200  ribonuclease H, putative  30.67 
 
 		 655 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0007  YacC  24.03 
 
 		 282 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1432  exonuclease  22.08 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6889  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.72 
 
 		 293 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.796423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0595  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.2 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.837923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1068  DNA polymerase III, epsilon chain  24.78 
 
 		 277 aa  41.6  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>