More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1561 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1561  xanthine/uracil permease family protein  100 
 
 
439 aa  866    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1372  xanthine/uracil permease family protein  93.17 
 
 
439 aa  817    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0281  xanthine/uracil permease family protein  99.09 
 
 
439 aa  857    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0428  xanthine/uracil permease family protein  68.05 
 
 
440 aa  598  1e-170  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1484  inner membrane protein YicO  58.49 
 
 
430 aa  496  1e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0583  xanthine/uracil permease family protein  58.26 
 
 
443 aa  496  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.628445  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0221  inner membrane protein YicO  58.18 
 
 
443 aa  478  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1685  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.42 
 
 
429 aa  456  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0399  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.64 
 
 
428 aa  438  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.69 
 
 
431 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  41.36 
 
 
431 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  39.72 
 
 
434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.98 
 
 
431 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  41.12 
 
 
431 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.15 
 
 
431 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  40.75 
 
 
431 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.73 
 
 
429 aa  316  4e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.68 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.68 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.19 
 
 
431 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.19 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.52 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.38 
 
 
430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.28 
 
 
431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  40.47 
 
 
442 aa  306  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.18 
 
 
432 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.47 
 
 
442 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  40.47 
 
 
442 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.18 
 
 
443 aa  305  8.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.42 
 
 
433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.9 
 
 
453 aa  302  8.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.01 
 
 
430 aa  302  9e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  42.24 
 
 
430 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  40.59 
 
 
433 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.59 
 
 
433 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.34 
 
 
440 aa  300  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  38.19 
 
 
433 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  42.24 
 
 
430 aa  301  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.18 
 
 
437 aa  301  2e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 
433 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.66 
 
 
433 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.66 
 
 
429 aa  300  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.45 
 
 
433 aa  299  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.9 
 
 
433 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.1 
 
 
433 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.1 
 
 
433 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.1 
 
 
433 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 
433 aa  297  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.66 
 
 
446 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  42.03 
 
 
428 aa  297  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.2 
 
 
433 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.48 
 
 
454 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  38.04 
 
 
433 aa  296  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.19 
 
 
433 aa  295  9e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.57 
 
 
429 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.57 
 
 
442 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  40.59 
 
 
453 aa  294  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  39.31 
 
 
465 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 
445 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.11 
 
 
429 aa  293  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  38.19 
 
 
429 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.62 
 
 
467 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.53 
 
 
430 aa  293  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.65 
 
 
441 aa  293  6e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.52 
 
 
429 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  39.09 
 
 
453 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  37.65 
 
 
433 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.74 
 
 
446 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  37.65 
 
 
433 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  37.65 
 
 
433 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  39.08 
 
 
465 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.57 
 
 
443 aa  290  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1528  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.28 
 
 
440 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000884717  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.41 
 
 
433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.23 
 
 
448 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.14 
 
 
470 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  38.72 
 
 
429 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.7 
 
 
445 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.395104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03548  predicted xanthine/uracil permase  38.23 
 
 
444 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0039  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.23 
 
 
444 aa  287  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3877  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.14 
 
 
470 aa  288  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  38.14 
 
 
470 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03490  hypothetical protein  38.23 
 
 
444 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  37.65 
 
 
445 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.47 
 
 
463 aa  288  2e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0035  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.23 
 
 
444 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.85 
 
 
431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.3 
 
 
429 aa  286  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  37.41 
 
 
445 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  37.41 
 
 
445 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  37.41 
 
 
445 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.71 
 
 
430 aa  286  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0570  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.26 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.46787  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.3 
 
 
432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  37.16 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.3 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  38.88 
 
 
429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.86 
 
 
436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  38.37 
 
 
430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4008  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.06 
 
 
445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>