93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3353 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  100 
 
 		 336 aa  685    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  73.72 
 
 		 334 aa  515  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  58.31 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  52.42 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  54.98 
 
 		 352 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  49.85 
 
 		 336 aa  345  6e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  51.86 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  53.05 
 
 		 338 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  50.31 
 
 		 342 aa  323  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  48.8 
 
 		 342 aa  316  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  48.5 
 
 		 342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  46.95 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  45.89 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  44.94 
 
 		 341 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  48.06 
 
 		 333 aa  290  4e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  45.54 
 
 		 345 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  45.54 
 
 		 345 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  45.43 
 
 		 352 aa  285  5e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  43.94 
 
 		 359 aa  279  6e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  45.37 
 
 		 350 aa  276  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  42.86 
 
 		 354 aa  275  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  42.32 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  43.55 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  44.59 
 
 		 334 aa  269  5e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  40.72 
 
 		 356 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  41.69 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  40.23 
 
 		 366 aa  258  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  44.44 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  42.11 
 
 		 335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  42.09 
 
 		 356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  41.23 
 
 		 340 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  42.56 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  40.79 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  40.71 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  42.86 
 
 		 340 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  42.9 
 
 		 357 aa  245  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  42.63 
 
 		 332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  40.31 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  45.42 
 
 		 281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  50.21 
 
 		 256 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  42.81 
 
 		 342 aa  242  7e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  39.35 
 
 		 350 aa  242  7.999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  41.8 
 
 		 344 aa  241  9e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  40.19 
 
 		 355 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  40.19 
 
 		 355 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  38.64 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  42.41 
 
 		 369 aa  239  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  39.69 
 
 		 353 aa  239  4e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  42.56 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  37.94 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  39.69 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  40.34 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  38.91 
 
 		 337 aa  235  9e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  39.8 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  38.82 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  43.22 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  37.29 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  44.78 
 
 		 242 aa  202  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  31.41 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  34.16 
 
 		 197 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  34.95 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  32.1 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  32.1 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  38.78 
 
 		 192 aa  116  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  41.6 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  41.67 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  43.31 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  43.65 
 
 		 329 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  38.14 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  38.52 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  38.84 
 
 		 141 aa  103  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  43.48 
 
 		 126 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  39.67 
 
 		 336 aa  103  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  42.11 
 
 		 127 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  39.47 
 
 		 144 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  38.21 
 
 		 333 aa  99  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  35.48 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  35.66 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  36.72 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  34.17 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  37.1 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  33.88 
 
 		 198 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  45.24 
 
 		 90 aa  84.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  50 
 
 		 164 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  35.9 
 
 		 154 aa  78.2  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  46.58 
 
 		 108 aa  74.3  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  36.36 
 
 		 121 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  28.21 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  46 
 
 		 81 aa  50.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0821  putative lipoprotein  27.37 
 
 		 120 aa  46.6  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1452  putative lipoprotein  27.37 
 
 		 120 aa  46.6  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  33.9 
 
 		 81 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>