30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2509 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  281  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  45.38 
 
 
136 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  45.76 
 
 
130 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  47.17 
 
 
138 aa  101  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  41.22 
 
 
137 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  40.31 
 
 
138 aa  97.8  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  43.52 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  37.4 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  36.36 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  35.77 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  39.53 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  41.03 
 
 
315 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  39.34 
 
 
131 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  37.5 
 
 
313 aa  84.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  34.88 
 
 
136 aa  84  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  39.47 
 
 
136 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.47 
 
 
316 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  37.72 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  38.79 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  37.29 
 
 
304 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  37.82 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  37.5 
 
 
312 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  33.33 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  32.76 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  35.9 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  34.19 
 
 
309 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  31.25 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  34.34 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  31.25 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2485  hypothetical protein  40.38 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>