35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1585 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1585  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  640    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3384  Radical SAM domain protein  47.95 
 
 		 313 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0740  Fe-S oxidoreductase-like  23.4 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0904  hypothetical protein  23.24 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8971  Radical SAM domain protein  22.04 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4772  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 353 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  hitchhiker  0.0000514716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.41 
 
 		 349 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 		 565 aa  53.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 391 aa  53.1  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  24.16 
 
 		 468 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3662  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  21.97 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 455 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 378 aa  46.6  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.91 
 
 		 319 aa  46.2  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  22.69 
 
 		 374 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 399 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8972  Radical SAM domain protein  21.58 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  22.65 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1600  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00947  Molybdopterin cofactor biosynthetic proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13382]  24.76 
 
 		 694 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 496 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  26.55 
 
 		 486 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50634  predicted protein  23.98 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.612985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  27.03 
 
 		 479 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  28.81 
 
 		 474 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.92 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  32.81 
 
 		 442 aa  43.1  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1302  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1639  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  25.89 
 
 		 322 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.687552  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 574 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 513 aa  42.7  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>