45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1558 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  65.62 
 
 		 230 aa  288  5.0000000000000004e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  63.11 
 
 		 232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  63.35 
 
 		 227 aa  281  7.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  56.11 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  56.11 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  56.11 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  50.91 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  54.38 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  44.5 
 
 		 216 aa  174  9e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  30.54 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  28.52 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  29.44 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  24.23 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  25.57 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  34.86 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  23.14 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  23.17 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  22.13 
 
 		 625 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  22.54 
 
 		 626 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  25.19 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  30.89 
 
 		 286 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  27.41 
 
 		 273 aa  52  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  21.84 
 
 		 292 aa  52  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  21.72 
 
 		 626 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  25.95 
 
 		 284 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  28.57 
 
 		 285 aa  49.3  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  23.94 
 
 		 275 aa  48.9  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  20.16 
 
 		 280 aa  48.9  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  23.86 
 
 		 273 aa  48.5  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  21.31 
 
 		 626 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  22.39 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  23.48 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  27.6 
 
 		 275 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  24 
 
 		 298 aa  45.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  22.62 
 
 		 278 aa  45.1  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  25.97 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  20.7 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  28.02 
 
 		 284 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  22.4 
 
 		 283 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  20.15 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  25.6 
 
 		 275 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  21.15 
 
 		 294 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  22.82 
 
 		 241 aa  41.6  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  24.16 
 
 		 271 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>