40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1450 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1450  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  100 
 
 		 341 aa  707    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20363  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1919  cytochrome c subfamily protein  57.8 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1816  hypothetical protein  57.88 
 
 		 349 aa  431  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1095  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome c1 subunit  47.89 
 
 		 375 aa  348  7e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  46.98 
 
 		 374 aa  347  1e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0545  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  46.72 
 
 		 374 aa  345  5e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1236  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  47.61 
 
 		 367 aa  329  4e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1199  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  46.98 
 
 		 374 aa  328  6e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0742  cytochrome c subfamily protein  46.33 
 
 		 288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1833  cytochrome c subfamily protein  46.33 
 
 		 288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.135185  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1919  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  39.73 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  34.02 
 
 		 278 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  25.26 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  23.81 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1535  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  27.88 
 
 		 236 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000513902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  23.01 
 
 		 233 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  22.17 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  22.57 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2107  cytochrome c1  19.39 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  20.69 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  19.49 
 
 		 240 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  20.64 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  21.16 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  21.16 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  21.16 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  20.89 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  21.16 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3673  cytochrome c1 precursor  28.03 
 
 		 252 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3705  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  28.03 
 
 		 252 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3648  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  28.03 
 
 		 252 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1807  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  28.03 
 
 		 259 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2696  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  28.03 
 
 		 252 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0993  cytochrome c1  24.27 
 
 		 219 aa  43.5  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.697791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3258  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  28.03 
 
 		 252 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2746  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  28.03 
 
 		 252 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3799  cytochrome c1  24.31 
 
 		 297 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  20.63 
 
 		 232 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  20.63 
 
 		 231 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  20.63 
 
 		 231 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  20.63 
 
 		 232 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>