83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1124 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1124  Holliday junction resolvase-like protein  100 
 
 		 124 aa  249  7e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0662125  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1578  Holliday junction resolvase-like protein  60.98 
 
 		 127 aa  150  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0377  Holliday junction resolvase-like protein  57.85 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0873  Holliday junction resolvase YqgF  54.4 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0928843  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0945  Holliday junction resolvase-like protein  50.81 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.854613  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0527  Holliday junction resolvase-like protein  51.22 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1364  Holliday junction resolvase-like protein  50.82 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.451878  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0738  Holliday junction resolvase-like protein  50 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.53595  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0663  Holliday junction resolvase-like protein  50.82 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.907248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1858  Holliday junction resolvase-like protein  37.21 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3169  Holliday junction resolvase-like protein  37.21 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0917  Holliday junction resolvase-like protein  37.21 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2747  Holliday junction resolvase-like protein  37.21 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1996  Holliday junction resolvase-like protein  37.21 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391575  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3147  Holliday junction resolvase-like protein  37.21 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.822464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3111  Holliday junction resolvase-like protein  37.21 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1463  Holliday junction resolvase-like protein  34.33 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2479  Holliday junction resolvase-like protein  33.85 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0738  Holliday junction resolvase-like protein  35.51 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0755  Holliday junction resolvase-like protein  35.51 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.302865  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2739  Holliday junction resolvase YqgF  32.09 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0474  Holliday junction resolvase YqgF  35.56 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00800439  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2326  Holliday junction resolvase-like protein  33.58 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0635951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2523  Holliday junction resolvase-like protein  35.25 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159244 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3963  Holliday junction resolvase-like protein  35.82 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0836  Holliday junction resolvase-like protein  35.07 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  hitchhiker  0.00221177 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0865  Holliday junction resolvase-like protein  35.07 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0383  Holliday junction resolvase-like protein  35.07 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3810  Holliday junction resolvase-like protein  33.08 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0869  Holliday junction resolvase-like protein  33.85 
 
 		 146 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3225  Holliday junction resolvase YqgF  30.6 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1828  Holliday junction resolvase YqgF  27.34 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0205  Holliday junction resolvase YqgF  32.8 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0873  Holliday junction resolvase YqgF  30.08 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3633  Holliday junction resolvase YqgF  30.6 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0938  Holliday junction resolvase YqgF  29.55 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1942  Holliday junction resolvase-like protein  31.11 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1969  Holliday junction resolvase-like protein  31.11 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0212683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3713  Holliday junction resolvase YqgF  29.55 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0658941  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0265  Holliday junction resolvase-like protein  30.77 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05800  Holliday junction resolvase YqgF  28.79 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.209228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4616  Holliday junction resolvase-like protein  31.78 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08551  endonuclease  30.53 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2800  Holliday junction resolvase YqgF  30.83 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08521  endonuclease  30.53 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.329669  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07901  endonuclease  28.57 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1378  Holliday junction resolvase-like protein  33.06 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2406  Holliday junction resolvase YqgF  30.83 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.406379  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0799  Holliday junction resolvase YqgF  30.08 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0456  Holliday junction resolvase-like protein  29.41 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0531997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5430  Holliday junction resolvase YqgF  29.41 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1491  Holliday junction resolvase-like protein  24.24 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000748947  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2742  Holliday junction resolvase-like protein  29.77 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0706  Holliday junction resolvase-like protein  30.6 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1165  RNase H-like ribonuclease  30.6 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.345189  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1032  Holliday junction resolvase YqgF  30.3 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3638  Holliday junction resolvase-like protein  30.77 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2580  Holliday junction resolvase-like protein  27.48 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0637  Holliday junction resolvase-like protein  31.58 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0417  Holliday junction resolvase YqgF  25.76 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0558  Holliday junction resolvase-like protein  29.1 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0059  Holliday junction resolvase-like protein  29.55 
 
 		 148 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4233  Holliday junction resolvase-like protein  27.34 
 
 		 137 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000272031  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3892  Holliday junction resolvase-like protein  28.57 
 
 		 146 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0367  Holliday junction resolvase YqgF  29.1 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2398  Holliday junction resolvase-like protein  31.85 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0366153  hitchhiker  0.00151496 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0458  Holliday junction resolvase YqgF  28.47 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3804  Holliday junction resolvase-like protein  28.15 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0796335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2554  Holliday junction resolvase YqgF  28.68 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4379  Holliday junction resolvase-like protein  28.36 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.556882  normal  0.251804 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0838  hypothetical protein  26.87 
 
 		 161 aa  40  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.115372  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1327  Holliday junction resolvase-like protein  32.85 
 
 		 141 aa  40  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.513618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0556  Holliday junction resolvase YqgF  25.95 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.901255  normal  0.0480752 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0138  Holliday junction resolvase-like protein  30.83 
 
 		 143 aa  40  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0094  Holliday junction resolvase YqgF  24.64 
 
 		 142 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0018567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4466  Holliday junction resolvase-like protein  26.62 
 
 		 137 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000283196 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4614  Holliday junction resolvase-like protein  26.62 
 
 		 137 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000846091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4130  Holliday junction resolvase-like protein  26.62 
 
 		 137 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000238321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4119  Holliday junction resolvase-like protein  26.62 
 
 		 137 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.61572e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1361  Holliday junction resolvase YqgF  27.82 
 
 		 160 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4282  Holliday junction resolvase-like protein  26.62 
 
 		 137 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000036093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3099  Holliday junction resolvase-like protein  29.5 
 
 		 137 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00212776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4469  Holliday junction resolvase-like protein  26.62 
 
 		 137 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000240455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>