256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1730 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1730  biotin--protein ligase  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0360  biotin--protein ligase  65.4 
 
 
211 aa  300  1e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0103057  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1533  biotin--protein ligase  56.4 
 
 
211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0094  biotin--protein ligase  55.34 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0106  biotin--protein ligase  55.83 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0134  biotin--protein ligase  55.34 
 
 
217 aa  241  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0679  biotin--protein ligase  48.34 
 
 
217 aa  218  5e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.622228  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0507  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  51.18 
 
 
211 aa  217  8.999999999999998e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0187  biotin--protein ligase  45.97 
 
 
211 aa  205  4e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1411  biotin--protein ligase  44.08 
 
 
211 aa  185  4e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6389  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.85 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00441767  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2770  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.85 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3332  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.99 
 
 
269 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0944  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.952458  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0935  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.05 
 
 
242 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04951  putative biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2999  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.08 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  29.3 
 
 
320 aa  58.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05900  birA, biotin-(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  29.5 
 
 
275 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.402573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1295  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.66 
 
 
266 aa  58.2  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2286  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.02 
 
 
243 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.76 
 
 
276 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.614952 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46706  predicted protein  27.92 
 
 
335 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.157574  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0086  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.65 
 
 
332 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1952  biotin operon repressor  25.45 
 
 
323 aa  57  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248115  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0204  biotin--protein ligase  29.38 
 
 
319 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1026  birA bifunctional protein  28.78 
 
 
323 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.812765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4404  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.8 
 
 
264 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2932  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.82 
 
 
259 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0240  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.76 
 
 
247 aa  55.8  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  30.22 
 
 
319 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  33.63 
 
 
293 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0153  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.36 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000128848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.62 
 
 
275 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4226  biotin--protein ligase  29.14 
 
 
305 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1295  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.07 
 
 
237 aa  55.5  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.486706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0073  biotin--protein ligase  26.67 
 
 
285 aa  55.1  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.702906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0490  biotin--protein ligase  29.94 
 
 
297 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0887139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0453  birA bifunctional protein  24.83 
 
 
301 aa  54.7  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2532  putative biotin protein ligase  27.78 
 
 
242 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0413921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0102  biotin--protein ligase  27.61 
 
 
305 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0432  putative biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.77 
 
 
249 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0614  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  24.83 
 
 
313 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.695389  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  35.58 
 
 
319 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  35.58 
 
 
319 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  35.58 
 
 
319 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1369  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.38 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0213578 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06231  putative biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.81 
 
 
252 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0412203 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0812  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.21 
 
 
336 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  31.3 
 
 
319 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1544  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.53 
 
 
323 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00491525  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0227  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.78 
 
 
262 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00038256 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1515  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.53 
 
 
323 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.567415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  31.86 
 
 
312 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  31.25 
 
 
319 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0875  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.43 
 
 
325 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1192  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.29 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.347029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3003  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.54 
 
 
269 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0468  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.54 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0418  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.21 
 
 
389 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0073656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  30.08 
 
 
320 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1721  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.2 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1418  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.3 
 
 
274 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1704  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  30.77 
 
 
326 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0104372  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0848  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.84 
 
 
251 aa  52.8  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.238001  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  32.38 
 
 
319 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1789  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.47 
 
 
326 aa  52.4  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02060  birA, biotin-(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  30 
 
 
189 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.526889  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4629  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.84 
 
 
283 aa  52.4  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2010  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.37 
 
 
227 aa  52.4  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06050  biotin--protein ligase  30.97 
 
 
330 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3992  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  24.19 
 
 
285 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.182521 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  32.69 
 
 
321 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  32.69 
 
 
321 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1447  birA bifunctional protein  30.77 
 
 
326 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.867427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1419  biotin operon repressor  30.77 
 
 
326 aa  52  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1420  biotin operon repressor  30.77 
 
 
326 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  32.69 
 
 
321 aa  52  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1560  bifunctional biotin operon repressor/biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase  30.77 
 
 
326 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  32.69 
 
 
321 aa  52  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  32.69 
 
 
321 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  32.69 
 
 
321 aa  52  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  32.69 
 
 
321 aa  52  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1631  biotin operon repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  30.77 
 
 
326 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.104533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  32.69 
 
 
321 aa  52  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0198  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.71 
 
 
237 aa  52  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0391  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.26 
 
 
240 aa  51.6  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1571  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.95 
 
 
330 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.929422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  29.33 
 
 
319 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  27.22 
 
 
320 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0734  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.87 
 
 
323 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.299053  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2082  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  24.48 
 
 
304 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.902523  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  27.22 
 
 
320 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  27.22 
 
 
320 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1261  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.47 
 
 
326 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  30.5 
 
 
319 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4741  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.82 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  27.22 
 
 
320 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1990  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.57 
 
 
251 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1476  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.95 
 
 
330 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>