51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2199 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2199  putative transport-associated  100 
 
 		 191 aa  381  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0589  phospholipid-binding domain-containing protein  82.32 
 
 		 183 aa  315  3e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0366  transport-associated, putative  50.79 
 
 		 191 aa  192  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2000  transport-associated protein  29.03 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0471437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  30.34 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  26.32 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  29.73 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  22.22 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  29.25 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  29.25 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  29.25 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2204  transport-associated  22.88 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  24.35 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  30 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  27.4 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  27.59 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  27.4 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  27.4 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  27.4 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  27.4 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  26.71 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  26.71 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  26.71 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  26.71 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  26.71 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  26.71 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  26.71 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  26.71 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  26.71 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3465  periplasmic protein  24.87 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3696  transport-associated  23.49 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.148519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  25.97 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  27.27 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3575  transport-associated protein  35.14 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.913691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  36.71 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1844  transport-associated  22.5 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  23.72 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  23.9 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  23.9 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  30.72 
 
 		 273 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  23.64 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  24.03 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4244  transport-associated protein  23.21 
 
 		 136 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  27.06 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  27.06 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  26.9 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  35.48 
 
 		 189 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0055  putative osmotically inducible protein  27.4 
 
 		 219 aa  41.6  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0270  transport-associated  31.51 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000691335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  25.83 
 
 		 273 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1310  transport-associated  25.18 
 
 		 179 aa  41.6  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0905482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>