More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0384 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0384  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 336 aa  679    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0184856  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1922  Holliday junction DNA helicase RuvB  91.37 
 
 		 338 aa  630  1e-180  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0737  Holliday junction DNA helicase RuvB  80.12 
 
 		 340 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0471  Holliday junction DNA helicase RuvB  80.98 
 
 		 343 aa  537  9.999999999999999e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.19 
 
 		 335 aa  531  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1364  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.19 
 
 		 335 aa  530  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1275  Holliday junction DNA helicase RuvB  76.79 
 
 		 336 aa  530  1e-149  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0287  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.3 
 
 		 335 aa  524  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0400  Holliday junction DNA helicase RuvB  75.37 
 
 		 340 aa  504  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1678  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.03 
 
 		 337 aa  481  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 		 341 aa  381  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.93 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.77 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.29 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.57 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.05 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.05 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.39 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.75 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.13 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.57 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.05 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.68 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.36 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.13 
 
 		 342 aa  371  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.13 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0655  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.8 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.57 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.19 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.13 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.89 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.39 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.82 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.43 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.15 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.49 
 
 		 541 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  56.77 
 
 		 346 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.1 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.82 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.68 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 333 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.78 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.53 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.6 
 
 		 334 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1205  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.69 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.62 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.31 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.37 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.36 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.94 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.68 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.63 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.8 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.05 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.92 
 
 		 351 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.19 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.45 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.84 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.68 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.92 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0333  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.77 
 
 		 338 aa  364  1e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.693851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.07 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.07 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.66 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  53.8 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1731  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.95 
 
 		 334 aa  363  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.707795  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0575  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.37 
 
 		 331 aa  363  3e-99  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1698  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.95 
 
 		 334 aa  363  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.07 
 
 		 334 aa  363  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.29 
 
 		 351 aa  362  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.76 
 
 		 334 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.68 
 
 		 336 aa  362  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>