More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11893 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  57.95 
 
 
569 aa  684    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11893  DNA polymerase III subunit gamma/tau  100 
 
 
600 aa  1240    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.272585  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4530  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  80.11 
 
 
361 aa  598  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162349  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0736  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.46 
 
 
602 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536606  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4930  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.73 
 
 
621 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522711  normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0023  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.48 
 
 
664 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0608754  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1233  DNA polymerase III, tau and gamma subunits  61.71 
 
 
381 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  40.99 
 
 
629 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.62 
 
 
634 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_002950  PG1418  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  41.69 
 
 
602 aa  429  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.733892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.72 
 
 
610 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1470  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.96 
 
 
617 aa  286  9e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0928579  normal  0.923251 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1322  DNA-directed DNA polymerase  44.29 
 
 
396 aa  283  8.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.403308  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  44.47 
 
 
396 aa  277  5e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1622  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.47 
 
 
401 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1652  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.98 
 
 
397 aa  273  9e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.675136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.65 
 
 
562 aa  271  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000227385  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1014  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.65 
 
 
398 aa  270  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.561354 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.5 
 
 
547 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.5 
 
 
547 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.85 
 
 
562 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.51 
 
 
522 aa  265  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.32 
 
 
562 aa  265  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.32 
 
 
562 aa  264  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.32 
 
 
562 aa  264  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.32 
 
 
562 aa  264  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.32 
 
 
562 aa  264  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.32 
 
 
562 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.32 
 
 
562 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.31 
 
 
559 aa  263  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.34 
 
 
551 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.56 
 
 
562 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.11 
 
 
582 aa  261  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.28 
 
 
562 aa  259  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.18 
 
 
567 aa  259  8e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.56 
 
 
562 aa  259  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.94 
 
 
570 aa  259  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.19 
 
 
599 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1228  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.83 
 
 
732 aa  258  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0388635 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.03 
 
 
561 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
579 aa  257  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  34.36 
 
 
579 aa  256  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.17 
 
 
579 aa  256  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.59 
 
 
534 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.92 
 
 
606 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.71 
 
 
613 aa  249  9e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4353  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.03 
 
 
663 aa  249  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.695185  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2215  AAA ATPase, central region  38.64 
 
 
650 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110333  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.62 
 
 
589 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.22 
 
 
602 aa  248  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.5 
 
 
601 aa  247  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.1 
 
 
550 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.5 
 
 
601 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.22 
 
 
554 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.53 
 
 
589 aa  246  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.6 
 
 
582 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.01 
 
 
612 aa  244  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.11 
 
 
588 aa  244  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.84 
 
 
547 aa  244  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.66 
 
 
570 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.16 
 
 
606 aa  244  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  41.32 
 
 
559 aa  243  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0276  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  46.98 
 
 
575 aa  243  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.48 
 
 
627 aa  241  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4057  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.44 
 
 
600 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.495634  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7346  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.2 
 
 
613 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  41.87 
 
 
625 aa  240  5e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.12 
 
 
550 aa  240  5e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  33.64 
 
 
499 aa  239  6.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0619  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.77 
 
 
623 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.72 
 
 
518 aa  239  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.32 
 
 
565 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.57 
 
 
644 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  41.32 
 
 
562 aa  239  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.18 
 
 
527 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0668  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.77 
 
 
627 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.27 
 
 
611 aa  238  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.49 
 
 
540 aa  239  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.32 
 
 
565 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.89 
 
 
518 aa  238  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.81 
 
 
569 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2168  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.7 
 
 
622 aa  237  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531905  normal  0.517298 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.77 
 
 
624 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.818033  normal  0.0455941 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4077  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.6 
 
 
626 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  37.77 
 
 
614 aa  236  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  37.39 
 
 
652 aa  236  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.52 
 
 
659 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  37.73 
 
 
548 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4848  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.77 
 
 
618 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4336  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3142  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.89 
 
 
637 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1812  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.7 
 
 
623 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181409  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1238  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.71 
 
 
634 aa  234  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0110  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.6 
 
 
631 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801093  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.78 
 
 
695 aa  234  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.5 
 
 
632 aa  233  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1861  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.99 
 
 
628 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.33363  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  43.6 
 
 
568 aa  233  8.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf158  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.17 
 
 
647 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.64 
 
 
427 aa  233  8.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4439  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.04 
 
 
730 aa  233  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>