More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05855 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 156 aa  317  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  82.52 
 
 		 163 aa  244  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  74.34 
 
 		 161 aa  226  7e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  68.15 
 
 		 183 aa  207  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1910  50S ribosomal protein L17  66.88 
 
 		 160 aa  201  5e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  58.49 
 
 		 194 aa  189  1e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4371  ribosomal protein L17  64.05 
 
 		 183 aa  185  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  57.5 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  56.77 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5759  ribosomal protein L17  60.54 
 
 		 204 aa  169  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  62.1 
 
 		 226 aa  167  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  49.34 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  48.65 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  55.83 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  55.83 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2395  50S ribosomal protein L17  47.62 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.409682  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  57.26 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  58.97 
 
 		 119 aa  138  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  50.33 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  52.38 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  53.72 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  55.56 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  53.23 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0513  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4723  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.268012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 125 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0509  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  47.26 
 
 		 152 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 119 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  52.42 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0652  ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  51.06 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  52.71 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  51.56 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  52.89 
 
 		 131 aa  130  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  52.99 
 
 		 132 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  52.89 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 128 aa  130  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 127 aa  130  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 127 aa  130  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 127 aa  130  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 127 aa  130  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 127 aa  130  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 127 aa  130  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 127 aa  130  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  52.5 
 
 		 127 aa  130  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  52.5 
 
 		 127 aa  130  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  52.99 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5054  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088451  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1823  50S ribosomal protein L17  46.85 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>