29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1081 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1081  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  852    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2460  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3848  hypothetical protein  30.48 
 
 		 401 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0831  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 423 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 		 439 aa  53.5  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6404  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.598711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 453 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 413 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 350 aa  47.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 1028 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 1398 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  29.77 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  29.81 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  26.83 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 424 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 379 aa  43.1  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>