25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2220 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5985  hypothetical protein  92.63 
 
 		 95 aa  175  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2598  hypothetical protein  64.89 
 
 		 90 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4611  CsbD family protein  49.33 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279751  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1706  hypothetical protein  48.24 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  45.45 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2001  CsbD family protein  40 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.992025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  46.67 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  46 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  41.51 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  43.4 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  42.59 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  43.4 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  55 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  41.51 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  38.78 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  29.52 
 
 		 114 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  38.78 
 
 		 118 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  32.43 
 
 		 82 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  33.33 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  38.78 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  33.87 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  33.87 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  37.1 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  32.43 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>