46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0214 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3230  hypothetical protein  50.11 
 
 
891 aa  843    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2401  hypothetical protein  81.78 
 
 
911 aa  1521    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.759091  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06286  conserved hypothetical protein  47.96 
 
 
1036 aa  832    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931044  normal  0.440135 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6278  hypothetical protein  75.08 
 
 
913 aa  1404    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7096  hypothetical protein  93.37 
 
 
935 aa  1746    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0399  hypothetical protein  51.07 
 
 
915 aa  903    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2091  hypothetical protein  52.25 
 
 
917 aa  897    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1812  hypothetical protein  52.82 
 
 
913 aa  922    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4437  hypothetical protein  54.64 
 
 
901 aa  982    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.43496  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4938  glucosidase  53.99 
 
 
896 aa  969    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0850212  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6985  hypothetical protein  48.49 
 
 
895 aa  763    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6603  hypothetical protein  73.66 
 
 
914 aa  1414    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3773  hypothetical protein  47.78 
 
 
887 aa  820    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6293  hypothetical protein  56.5 
 
 
869 aa  1002    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0409  hypothetical protein  51.3 
 
 
915 aa  905    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17410  hypothetical protein  44.48 
 
 
912 aa  697    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.567848  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1838  hypothetical protein  49.55 
 
 
893 aa  837    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.307747  normal  0.469868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5404  hypothetical protein  48.32 
 
 
896 aa  842    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.379787  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1861  hypothetical protein  52.83 
 
 
892 aa  956    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507599  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2302  hypothetical protein  54.43 
 
 
903 aa  962    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0370449  hitchhiker  0.000942014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2521  hypothetical protein  51.18 
 
 
885 aa  914    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343872  normal  0.100285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1748  hypothetical protein  46.43 
 
 
911 aa  739    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0575728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0673  hypothetical protein  51.51 
 
 
910 aa  875    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0857899 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0671  hypothetical protein  46.73 
 
 
901 aa  762    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.466888  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0214  hypothetical protein  100 
 
 
933 aa  1918    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4080  hypothetical protein  50.91 
 
 
912 aa  892    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336495  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2813  glucosidase  53.92 
 
 
881 aa  987    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.125423  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3432  glucosidase  51.76 
 
 
883 aa  956    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1574  glucosidase  50.29 
 
 
890 aa  867    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.786209  normal  0.991499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1943  hypothetical protein  52.71 
 
 
891 aa  954    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637433  normal  0.041134 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1825  hypothetical protein  46.73 
 
 
897 aa  769    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0133367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0406  hypothetical protein  50.82 
 
 
919 aa  912    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87266  conserved hypothetical protein  48.71 
 
 
1047 aa  847    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.483888  normal  0.444836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2632  hypothetical protein  52.3 
 
 
921 aa  887    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4427  hypothetical protein  48.28 
 
 
901 aa  760    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2768  hypothetical protein  54 
 
 
886 aa  972    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.693852  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5810  hypothetical protein  58.48 
 
 
881 aa  992    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  hitchhiker  0.00193239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1773  hypothetical protein  57.5 
 
 
905 aa  983    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3385  hypothetical protein  61 
 
 
890 aa  1078    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0706228 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04580  cytoplasm protein, putative  51.02 
 
 
1144 aa  614  9.999999999999999e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  24.45 
 
 
732 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  32 
 
 
708 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  25.96 
 
 
852 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  22.14 
 
 
718 aa  48.9  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  20.98 
 
 
721 aa  49.3  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  24.57 
 
 
543 aa  48.5  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.440373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>