93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4764 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4764  DoxX  100 
 
 		 119 aa  233  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  39.2 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  42.25 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  43.66 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  34.35 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  37.5 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  36.04 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  37.84 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  37.84 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  40.83 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  37.84 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  38.03 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  39.51 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  31.86 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  38.75 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  36.36 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  37.5 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  40 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  30.65 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  40 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3412  DoxX family protein  37.18 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.464952 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  32.26 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5199  DoxX family protein  39.39 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342492  normal  0.27185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  25.56 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4671  DoxX family protein  39.39 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  30.4 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  31.03 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  28.57 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  36.49 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  35.53 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  38.46 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  35.14 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  35.14 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  35.82 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  35.14 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  35.82 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  35.82 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  35.82 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4958  DoxX family protein  40.91 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00723227 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  28.87 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5311  DoxX family protein  40.91 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.482098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3056  DoxX  40.91 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  38.81 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  35.71 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  29.41 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  25.58 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  38.81 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0336  DoxX family membrane protein  37.18 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  29.41 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  28.3 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  29.41 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  32.73 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  29.58 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  37.31 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2945  DoxX  25.18 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  30.83 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  32.17 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  31.25 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  39.13 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  30.16 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  43.08 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  28.23 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  28.23 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  42.65 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  28.83 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0873  DoxD-like family protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1426  DoxD-like family protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.639544  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1877  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0464  DoxX family protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.412831  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0561  DoxX family membrane protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2188  DoxD-like family protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39427  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  35.71 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  33.61 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  30.77 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2205  DoxX  27.35 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000990864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  37.5 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3393  DoxX family protein  30.28 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  29.87 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  29.84 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  30.68 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  29.84 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5054  DoxX family protein  44.07 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  34.29 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1273  DoxX family protein  40.32 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3519  DoxX family protein  29.36 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3877  hypothetical protein  35.37 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52615  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3431  DoxX family protein  35.14 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  32.47 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  44.78 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  34.33 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5736  DoxX family protein  35.48 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  31.25 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  25.41 
 
 		 160 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>