123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3497 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3497  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 75 aa  154  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  48.39 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  46.03 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  37.7 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  43.33 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  41.67 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  36.67 
 
 		 64 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 68 aa  52  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2989  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  41.67 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  39.34 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1627  hypothetical protein  36.67 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  40.98 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  41.67 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2899  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1368  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 73 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3228  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  35 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  34.38 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 76 aa  47.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  40.35 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  34.43 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3404  hypothetical protein  29.85 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0716  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.162111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2321  hypothetical protein  33.85 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  0.0000308968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  39.62 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  36.51 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 797 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  39.62 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  32.79 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0030  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.962189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0028  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 1061 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  39.39 
 
 		 1061 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  34.48 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  27.27 
 
 		 835 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0386  hypothetical protein  32.79 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000012087 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 1061 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 1063 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0389  hypothetical protein  34.43 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0394  hypothetical protein  34.43 
 
 		 64 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593872  hitchhiker  1.762e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0449  hypothetical protein  34.43 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68228e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0408  hypothetical protein  34.43 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000230942 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>