24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2302 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2302  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  577  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00342801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1705  hypothetical protein  70.97 
 
 		 284 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1474  hypothetical protein  66 
 
 		 265 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4797  hypothetical protein  55.25 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4293  PGAP1 family protein  55.04 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000482527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3646  hypothetical protein  52.7 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1818  hypothetical protein  52.21 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1654  hypothetical protein  49.59 
 
 		 262 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3470  PGAP1 family protein  45.54 
 
 		 264 aa  192  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2469  hypothetical protein  47.19 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505624  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3553  PGAP1 family protein  43.7 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11216  hypothetical protein  47.11 
 
 		 275 aa  178  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1764  hypothetical protein  43.39 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1301  hypothetical protein  44.5 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130537  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2778  hypothetical protein  33.5 
 
 		 269 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0282  hypothetical protein  33.85 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0784  PGAP1 family protein  30.62 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  30 
 
 		 264 aa  85.9  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  26.32 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  29.44 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  29.17 
 
 		 338 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  31.05 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  27.43 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  29.23 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>