153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6523 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6523  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
145 aa  296  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0816552  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  77.1 
 
 
131 aa  207  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  37.12 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  46.05 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  44.59 
 
 
133 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  44.59 
 
 
133 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  54.55 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  54.55 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  54.55 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  51.02 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  46.3 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  49.12 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  49.12 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  49.12 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  49.12 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  49.12 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  49.12 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  58.14 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  39.83 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  49.12 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  49.12 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  49.12 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  49.12 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  49.12 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  49.12 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  49.12 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  49.12 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  49.12 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  49.12 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  49.12 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  49.12 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  49.12 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  49.12 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  49.09 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  48.33 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  48.33 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  48.33 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  48.33 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  48.33 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  48.33 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  32.77 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  37.4 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  46.67 
 
 
122 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  40 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  46.67 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  46.67 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  46.67 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  31.82 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  34.4 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  34.4 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  42.86 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4875  transposase IS3/IS911 family protein  32.76 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64301  normal  0.539748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  34.33 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  27.83 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  36.99 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  45 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  33.33 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  33.33 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  37.5 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  34.52 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  32.12 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  28.7 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  28.7 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  28.7 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  28.7 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  28.7 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  28.7 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  28.7 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  28.7 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  28.7 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  28.7 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  28.7 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  34.52 
 
 
225 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  34.52 
 
 
225 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  28.7 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  28.7 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  28.7 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  28.7 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  34.52 
 
 
225 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  34.52 
 
 
225 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  34.52 
 
 
225 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  34.52 
 
 
225 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  30.23 
 
 
135 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  30.23 
 
 
135 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  30.23 
 
 
135 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  30.23 
 
 
135 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  30.23 
 
 
135 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  30.23 
 
 
135 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  30.23 
 
 
135 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  30.23 
 
 
135 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  30.23 
 
 
135 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  30.23 
 
 
135 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4652  transposase IS3/IS911 family protein  33.02 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.110926  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>