46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0228 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 239 aa  495  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  54.43 
 
 		 263 aa  249  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  50.62 
 
 		 236 aa  248  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  49.37 
 
 		 238 aa  248  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  49.79 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  52.54 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.04 
 
 		 246 aa  244  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  52.14 
 
 		 268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  52.94 
 
 		 263 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  52.94 
 
 		 263 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.52 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  48.54 
 
 		 273 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  59.47 
 
 		 245 aa  238  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  48.32 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  48.12 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.95 
 
 		 245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  47.28 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.69 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  47.7 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  45.99 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  53 
 
 		 217 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.41 
 
 		 238 aa  211  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  47.64 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.95 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4243  twin-arginine translocation pathway signal  51.61 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33660  dehydrogenase small subunit  38.98 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.563663  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  37.7 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0463  hypothetical protein  31.03 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0438  hypothetical protein  30.6 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.904473  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0229  hypothetical protein  30.89 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1313  hypothetical protein  35.75 
 
 		 361 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3896  hypothetical protein  34.78 
 
 		 240 aa  99  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1597  hypothetical protein  27.88 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5398  hypothetical protein  31.75 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1924  hypothetical protein  29.95 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.4 
 
 		 755 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  25.44 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5468  hypothetical protein  25.91 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6388  hypothetical protein  26.29 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1287  hypothetical protein  23.32 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.25253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2789  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  24.1 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5508  hypothetical protein  26.32 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108926  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3000  hypothetical protein  24.29 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.117873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4193  hypothetical protein  27.38 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  23.81 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2659  hypothetical protein  26.6 
 
 		 182 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>