62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0015 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  65.78 
 
 		 1140 aa  1441    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  56.88 
 
 		 1144 aa  1271    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  65.3 
 
 		 1133 aa  1389    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  56.79 
 
 		 1143 aa  1257    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  100 
 
 		 1124 aa  2286    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  64.18 
 
 		 1121 aa  1413    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  63.91 
 
 		 1122 aa  1407    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  45.04 
 
 		 1123 aa  853    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  65.29 
 
 		 1121 aa  1439    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  64.3 
 
 		 1121 aa  1418    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  60.55 
 
 		 1125 aa  1335    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  63.9 
 
 		 1125 aa  1407    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  61.87 
 
 		 1121 aa  1360    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  65.59 
 
 		 1121 aa  1429    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  47.4 
 
 		 1130 aa  942    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  45.9 
 
 		 1166 aa  943    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  30.64 
 
 		 1133 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1126 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  32.53 
 
 		 1143 aa  456  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  31.84 
 
 		 1124 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1137 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1128 aa  376  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  25.59 
 
 		 1136 aa  301  6e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1120 aa  285  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1118 aa  272  2.9999999999999997e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  52.44 
 
 		 352 aa  255  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1120 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  24.77 
 
 		 1153 aa  224  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1120 aa  224  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1120 aa  224  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1118 aa  221  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1126 aa  219  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  24.96 
 
 		 1154 aa  214  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1121 aa  202  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1045 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  25.29 
 
 		 979 aa  186  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1146 aa  181  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1114 aa  167  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1151 aa  159  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1120 aa  152  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1125 aa  152  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  24.6 
 
 		 694 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1181 aa  111  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  25.38 
 
 		 462 aa  87.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  26.6 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1159 aa  65.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1159 aa  65.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  21.38 
 
 		 1093 aa  65.1  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  29.02 
 
 		 1159 aa  65.1  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1214 aa  62.4  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  26.64 
 
 		 1228 aa  62  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  24.18 
 
 		 1159 aa  61.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  24.22 
 
 		 1107 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0895  hypothetical protein  64.86 
 
 		 54 aa  57.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  19.89 
 
 		 1113 aa  52.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1141 aa  49.7  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  30 
 
 		 1138 aa  49.7  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1145 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  24.89 
 
 		 1207 aa  48.9  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  23.04 
 
 		 1109 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0773  hypothetical protein  58.82 
 
 		 109 aa  46.2  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187735  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  36.36 
 
 		 604 aa  46.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>