136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5452 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5452  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
243 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0473701 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2887  Beta-lactamase-like protein  65.42 
 
 
248 aa  321  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3079  beta-lactamase domain protein  67.08 
 
 
248 aa  308  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2974  beta-lactamase-like protein  65.98 
 
 
252 aa  307  8e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3489  hypothetical protein  61.64 
 
 
242 aa  304  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.969002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3660  beta-lactamase domain-containing protein  53.02 
 
 
239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5304  hypothetical protein  50.21 
 
 
258 aa  219  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0594  hypothetical protein  46.96 
 
 
240 aa  202  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1524  hypothetical protein  47.75 
 
 
249 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0461  hypothetical protein  45.99 
 
 
247 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.304933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0472  hypothetical protein  45.99 
 
 
247 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.249938  normal  0.535874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0448  hypothetical protein  45.99 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0281  hypothetical protein  51.7 
 
 
163 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0229241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  30.17 
 
 
404 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1371  flavin reductase-like, FMN-binding  25.49 
 
 
576 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0538  Beta-lactamase-like  25.65 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2284  uncharacterized flavoprotein  27.46 
 
 
411 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  24.88 
 
 
404 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 
387 aa  58.9  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  22.58 
 
 
400 aa  58.5  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  28.45 
 
 
387 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  22.18 
 
 
396 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4140  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  28.57 
 
 
572 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1439  flavin reductase-like, FMN-binding  29.41 
 
 
579 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1163  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  26.76 
 
 
582 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 
399 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  24.17 
 
 
402 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0086  hypothetical protein  24.5 
 
 
213 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307031  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.06 
 
 
575 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2889  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 
410 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.726482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  24.66 
 
 
402 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3604  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.85 
 
 
576 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 
405 aa  55.5  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 
401 aa  55.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0504  beta-lactamase domain protein  22.13 
 
 
405 aa  55.1  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.85 
 
 
576 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0876298  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 
397 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.37 
 
 
575 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  22.08 
 
 
396 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.37 
 
 
575 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  25 
 
 
399 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 
387 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 
400 aa  53.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  23.7 
 
 
402 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2086  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 
394 aa  52.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.78 
 
 
574 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0503  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 
401 aa  52.8  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0527629  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2027  flavodoxin/nitric oxide synthase  20.77 
 
 
404 aa  52.4  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.719198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  25.73 
 
 
399 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  25.73 
 
 
399 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4522  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 
234 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.88502  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5045  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 
234 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521879  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  22.07 
 
 
414 aa  52  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1438  flavin reductase-like, FMN-binding  26.27 
 
 
597 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  25 
 
 
397 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 
407 aa  52  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 
425 aa  52  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0941  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  22.71 
 
 
394 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
402 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  29.71 
 
 
423 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 
322 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0479  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.35 
 
 
575 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1802  flavin reductase-like, FMN-binding  24.65 
 
 
574 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  23.5 
 
 
406 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4139  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  25.85 
 
 
601 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 
395 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  25.22 
 
 
396 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 
407 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1679  beta-lactamase domain protein  22.87 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2557  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.583667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  27.83 
 
 
395 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  22.22 
 
 
418 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  23.5 
 
 
406 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  24.62 
 
 
574 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
391 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 
395 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0302  flavin reductase-like, FMN-binding  23.94 
 
 
575 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225736  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0172  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.26 
 
 
398 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 
407 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23 
 
 
503 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  24.11 
 
 
392 aa  45.4  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  21.7 
 
 
401 aa  45.4  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2746  beta-lactamase domain-containing protein  22.77 
 
 
244 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.512099 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  24.8 
 
 
407 aa  45.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  25.6 
 
 
407 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1809  flavoprotein  25.35 
 
 
571 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2771  beta-lactamase-like protein  24.16 
 
 
378 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  20.56 
 
 
397 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119390  Diflavin flavoprotein A 1-like protein  25.93 
 
 
638 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254321  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0174  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.5 
 
 
398 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0356  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.22 
 
 
494 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  23.89 
 
 
407 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1459  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.56 
 
 
573 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  23.67 
 
 
570 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  24.79 
 
 
878 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0955  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 
409 aa  43.9  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.86403  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  22.79 
 
 
479 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>