23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2460 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2460  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
419 aa  860    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0831  glycosyl transferase group 1  62.16 
 
 
423 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3848  hypothetical protein  62.31 
 
 
401 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1081  hypothetical protein  30.59 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6404  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
399 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.598711 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
378 aa  55.1  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  34.81 
 
 
396 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
377 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
358 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
379 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
761 aa  46.6  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
396 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  38.3 
 
 
401 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
351 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
386 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
366 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  26.6 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
364 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>