39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2345 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2345  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.0903937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7103  PepSY-associated TM helix domain protein  70.71 
 
 		 240 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0220  hypothetical protein  70.71 
 
 		 240 aa  346  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6407  hypothetical protein  66.33 
 
 		 244 aa  291  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3576  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  60.62 
 
 		 233 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.548586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4478  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  64.56 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5003  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  62.21 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.862813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3055  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  63.43 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4358  hypothetical protein  65.83 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2969  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  56.44 
 
 		 244 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137689  normal  0.135359 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2444  PepSY-associated TM helix  66.33 
 
 		 231 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3058  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  66.33 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3077  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  66 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3103  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  65.19 
 
 		 231 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0422  PepSY-associated TM helix family protein  56.03 
 
 		 248 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3287  hypothetical protein  56.03 
 
 		 248 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2952  hypothetical protein  63.44 
 
 		 239 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.442146  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2136  hypothetical protein  63.44 
 
 		 239 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0240  hypothetical protein  63.44 
 
 		 239 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3394  hypothetical protein  63.44 
 
 		 239 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0228  hypothetical protein  62.9 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.165958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0206  PepSY-associated TM helix family protein  54.74 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2998  PepSY-associated TM helix domain protein  39.26 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3345  PepSY-associated TM helix domain protein  40.91 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3067  hypothetical protein  38 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.387636 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2392  PepSY-associated TM helix  39.8 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.932712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0088  hypothetical protein  73.58 
 
 		 54 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.98 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  27.72 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  24.02 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1500  PepSY-associated TM helix domain protein  24.12 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2661  hypothetical protein  26.36 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.522386  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  24.63 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.57 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  24.54 
 
 		 199 aa  46.2  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  24.32 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  25 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.94 
 
 		 208 aa  42.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  20.92 
 
 		 177 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>