195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2617 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2617  Rubrerythrin  100 
 
 
202 aa  407  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0568  Rubrerythrin  37.08 
 
 
179 aa  123  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  39.11 
 
 
164 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  37.79 
 
 
158 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  40.91 
 
 
164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  40 
 
 
164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  37.29 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  36.67 
 
 
166 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  36.67 
 
 
166 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  35.75 
 
 
202 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  37.79 
 
 
167 aa  106  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  35.56 
 
 
166 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  36.31 
 
 
202 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  34.46 
 
 
166 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  35.71 
 
 
166 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  35.75 
 
 
165 aa  105  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  37.43 
 
 
202 aa  104  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  34.08 
 
 
168 aa  104  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  33.33 
 
 
166 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  35.59 
 
 
166 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  34.46 
 
 
166 aa  102  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  33.15 
 
 
166 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  32.18 
 
 
163 aa  102  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  33.33 
 
 
165 aa  100  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  33.71 
 
 
165 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  33.33 
 
 
166 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  34.46 
 
 
166 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  37.5 
 
 
167 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  32.96 
 
 
165 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  34.25 
 
 
165 aa  98.6  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  33.9 
 
 
166 aa  98.2  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  34.29 
 
 
167 aa  98.2  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  34.27 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  35.52 
 
 
263 aa  97.1  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  34.83 
 
 
163 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  31.84 
 
 
166 aa  96.7  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0398  Rubrerythrin  38.33 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  32.97 
 
 
197 aa  96.3  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  32.96 
 
 
182 aa  95.9  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  33.15 
 
 
182 aa  95.5  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  31.91 
 
 
167 aa  95.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  35.59 
 
 
164 aa  95.1  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  32.2 
 
 
166 aa  95.1  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  35.8 
 
 
165 aa  94  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  32.97 
 
 
165 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  32.42 
 
 
165 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  32.62 
 
 
194 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  32.09 
 
 
194 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  33.33 
 
 
164 aa  93.6  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  32.09 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  33.15 
 
 
172 aa  93.2  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  31.11 
 
 
166 aa  92.8  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  30.17 
 
 
185 aa  91.3  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  34.44 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  32.2 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  33.9 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  35.43 
 
 
168 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  32.02 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  33.52 
 
 
166 aa  89  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  33.92 
 
 
168 aa  89.4  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  32.8 
 
 
170 aa  88.6  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  33.52 
 
 
185 aa  88.2  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  30.56 
 
 
184 aa  87.8  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  31.64 
 
 
166 aa  87.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  31.75 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  30.85 
 
 
190 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  34.46 
 
 
168 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  31.82 
 
 
166 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  31.82 
 
 
168 aa  85.5  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  31.87 
 
 
191 aa  85.9  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  30.77 
 
 
179 aa  85.1  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  35.1 
 
 
182 aa  85.1  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  30.48 
 
 
194 aa  84.7  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  27.32 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  26.82 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  29.55 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  30 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  29.55 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  30.94 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  32.78 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  30.39 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  32.78 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  28.02 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  27.96 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  32.22 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  30.68 
 
 
214 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  29.61 
 
 
169 aa  79  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  28.65 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  29.28 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  29.94 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  30.56 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  30.22 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  29.95 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  28.04 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  28.5 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  29.28 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  28.26 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  27.07 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  27.07 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  29.38 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>