184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0568 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0568  Rubrerythrin  100 
 
 
179 aa  371  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2617  Rubrerythrin  37.08 
 
 
202 aa  105  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  32.95 
 
 
168 aa  92  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  31.4 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  33.52 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  32.18 
 
 
158 aa  89  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  30.64 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  29.24 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  31.07 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  32.58 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  28.9 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  31.76 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  28 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  28.57 
 
 
194 aa  79  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  32.35 
 
 
166 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  28.19 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  31.79 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  29.71 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  29.89 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  32.02 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  30.17 
 
 
191 aa  77  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  29.03 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  29.89 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  30.81 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  28.19 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  31.03 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  32.35 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  29.78 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  32.04 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  28.89 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  28.65 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  30.65 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  32.94 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  29.94 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  30.77 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  30.73 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  29.44 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  29.61 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  34.52 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  29.28 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  27.53 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  30.9 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  28.33 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  29.51 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  27.53 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  27.53 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  29.14 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  28.33 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  29.78 
 
 
202 aa  70.9  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  30 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  27.93 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  29.03 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  29.14 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  30.39 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  28 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  28.88 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  28.89 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  27.91 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  28.65 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  31.43 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  28.16 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  26.4 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  30.06 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  27.75 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  29.14 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  28.26 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  28.65 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  27.33 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  27.32 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  30.56 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  29.14 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  28.57 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  27.78 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  30 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  28.74 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  27.47 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  27.44 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  28.18 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  28.49 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  27.22 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  28.33 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  29.05 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  30.18 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  27.68 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  28.9 
 
 
166 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  29.05 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  28.09 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  27.01 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  28.89 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  28.65 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  28.27 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  27.27 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  29.14 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  28.26 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  30.37 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  26.97 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  26.67 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  25.27 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  26.09 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  28.65 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>