More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1953 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  42.78 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  41.3 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  42.39 
 
 		 176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  42.62 
 
 		 177 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  41.85 
 
 		 176 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  40.4 
 
 		 185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  42.31 
 
 		 178 aa  155  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  41.18 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  41.18 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  40.64 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  44.32 
 
 		 175 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  41.94 
 
 		 183 aa  151  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  40.64 
 
 		 176 aa  151  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  40.11 
 
 		 176 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  40.64 
 
 		 176 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  39.68 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  40.11 
 
 		 176 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  39.57 
 
 		 176 aa  150  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  39.57 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  38.5 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  41.53 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  41.53 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  40 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  38.5 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  38.5 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  40.44 
 
 		 177 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  41.4 
 
 		 177 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  39.34 
 
 		 177 aa  148  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  38.5 
 
 		 176 aa  148  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  41.53 
 
 		 177 aa  148  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  41.08 
 
 		 174 aa  148  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  38.58 
 
 		 184 aa  147  9e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  41.62 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  40.76 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  41.3 
 
 		 176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  37.77 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  40.98 
 
 		 175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  42.39 
 
 		 177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  42.08 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  42.16 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0421  NusG antitermination factor  37.7 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000362021  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  40.53 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  42.55 
 
 		 177 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  38.58 
 
 		 184 aa  144  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  42.55 
 
 		 177 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  39.27 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  42.02 
 
 		 177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  42.02 
 
 		 177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  39.47 
 
 		 306 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  42.02 
 
 		 177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  41.03 
 
 		 182 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  38.25 
 
 		 177 aa  144  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  42.02 
 
 		 177 aa  144  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  41.85 
 
 		 175 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  38.5 
 
 		 176 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  42.02 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  40.22 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  39.13 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  40.22 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  41.53 
 
 		 273 aa  143  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00050  putative transcription antitermination protein  35.6 
 
 		 183 aa  144  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  37.7 
 
 		 183 aa  144  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  39.89 
 
 		 180 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  37.57 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  41.71 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  41.71 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  40.51 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  40.51 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  37.57 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  40.98 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  41.53 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  37.23 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  37.57 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  36.9 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  37.43 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  40 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  39.09 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  37.63 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  39.57 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  39.04 
 
 		 238 aa  141  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  39.34 
 
 		 177 aa  141  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  45.36 
 
 		 177 aa  141  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  38.04 
 
 		 176 aa  141  7e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  36.9 
 
 		 177 aa  141  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  38.97 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  38.97 
 
 		 185 aa  141  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  38.97 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  40.98 
 
 		 177 aa  141  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  38.97 
 
 		 185 aa  141  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  38.97 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  38.97 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  38.97 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  38.97 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  38.97 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  37.1 
 
 		 194 aa  140  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  38.97 
 
 		 267 aa  140  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  40.22 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  41.53 
 
 		 277 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  37.43 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>