More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0317 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0317  Ribonuclease H  100 
 
 		 163 aa  333  9e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  50.75 
 
 		 152 aa  147  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  50.72 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  52.21 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  49.65 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  46.81 
 
 		 148 aa  143  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  48.92 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  47.06 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  46.05 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  45.99 
 
 		 143 aa  140  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  47.52 
 
 		 145 aa  140  9e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  49.29 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1836  ribonuclease H  40 
 
 		 151 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1987  ribonuclease H  42.04 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  45.39 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1479  RNase HI  45.89 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00461786  normal  0.20485 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  46.76 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  46.21 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  51.82 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  50 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  48.92 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  45.33 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  48.57 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  50 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  48.57 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  44.59 
 
 		 159 aa  137  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  53.68 
 
 		 147 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4905  ribonuclease H  41.29 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  44.37 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  50 
 
 		 146 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  47.86 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  45.71 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  45.89 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  47.18 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  47.86 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  46.1 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  45.39 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  45.39 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  45 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  45.39 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  45.39 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  45.39 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  46.1 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  45.39 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  46.1 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  44.44 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  44.85 
 
 		 163 aa  134  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  42.66 
 
 		 150 aa  134  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  44.9 
 
 		 150 aa  134  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  43.88 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  43.88 
 
 		 148 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  44.68 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4730  ribonuclease H  41.33 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  44.68 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  48.15 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4350  ribonuclease H  41.33 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665268  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  44 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  46.67 
 
 		 269 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4436  ribonuclease H  41.33 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  47.79 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  46.1 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  45.99 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  45.39 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  48.53 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  46.1 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  43.8 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  45.39 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  45.39 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  44.68 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  45.19 
 
 		 142 aa  132  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  47.41 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  47.41 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  43.95 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  42.96 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  40.43 
 
 		 235 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  45.65 
 
 		 147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0905  ribonuclease H  43.17 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.690877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  44.44 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  43.06 
 
 		 175 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  44.85 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  41.96 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  42.47 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  43.36 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  45.21 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  45.21 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  45.64 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  43.97 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  40.4 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  43.38 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  45.99 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  45 
 
 		 527 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  44.12 
 
 		 145 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1619  ribonuclease H  45.52 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  44.85 
 
 		 145 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  41.89 
 
 		 146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  42.65 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  43.54 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  42.65 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  41.45 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  41.96 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>