More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0220 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  64.38 
 
 
759 aa  993    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  64.51 
 
 
759 aa  995    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  48.4 
 
 
752 aa  697    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  95.11 
 
 
756 aa  1467    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  47.36 
 
 
759 aa  638    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1010  malic enzyme  67.24 
 
 
765 aa  1001    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0551739 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  95.11 
 
 
756 aa  1467    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  67.69 
 
 
773 aa  1018    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2767  malic enzyme  66.22 
 
 
781 aa  984    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0582903  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4759  malic enzyme  62.63 
 
 
770 aa  921    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1646  malic enzyme  63.48 
 
 
774 aa  910    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186396  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  95.11 
 
 
756 aa  1467    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3439  malic enzyme  64.95 
 
 
771 aa  973    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1095  malic enzyme  65.85 
 
 
766 aa  981    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1017  malic enzyme  59.49 
 
 
774 aa  875    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0807  malic enzyme  64.49 
 
 
768 aa  947    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0224  malic enzyme  63.95 
 
 
773 aa  963    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4071  malic enzyme  62.95 
 
 
776 aa  914    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0274  malic enzyme  54.15 
 
 
759 aa  810    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  64.25 
 
 
759 aa  992    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0396  malic enzyme  64.95 
 
 
769 aa  971    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2477  malic enzyme  64.95 
 
 
769 aa  971    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.622597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  95.11 
 
 
756 aa  1467    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0207  malic enzyme  64.67 
 
 
764 aa  952    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.850785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  45.53 
 
 
751 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0984  malic enzyme  59.63 
 
 
774 aa  875    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  58.5 
 
 
779 aa  907    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0666  malic enzyme  64.72 
 
 
759 aa  963    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121288  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  68.22 
 
 
758 aa  1045    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  68.15 
 
 
777 aa  1042    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2847  malic enzyme  64.78 
 
 
774 aa  949    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2100  malic enzyme  60.03 
 
 
774 aa  858    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  57.12 
 
 
757 aa  850    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1587  malic enzyme  57.48 
 
 
760 aa  843    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  95.11 
 
 
773 aa  1469    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3474  malic enzyme  64.95 
 
 
769 aa  973    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4106  malic enzyme  64.49 
 
 
770 aa  940    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  47.06 
 
 
783 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  47.8 
 
 
752 aa  665    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  45.53 
 
 
759 aa  643    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1593  malic enzyme  55.47 
 
 
759 aa  822    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  95.77 
 
 
756 aa  1484    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3713  malic enzyme  64.77 
 
 
785 aa  973    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302892  normal  0.094119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2662  malic enzyme  62.4 
 
 
782 aa  942    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  48.06 
 
 
752 aa  704    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  48.4 
 
 
749 aa  676    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3309  malic enzyme  64.95 
 
 
769 aa  971    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1112  malic enzyme  65.82 
 
 
769 aa  983    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2224  malic enzyme  54.71 
 
 
759 aa  826    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  48.13 
 
 
753 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1189  malic enzyme  64.95 
 
 
768 aa  972    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  95.11 
 
 
756 aa  1468    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  48.34 
 
 
771 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2497  malic enzyme  57.35 
 
 
769 aa  798    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  59.3 
 
 
779 aa  925    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  58.2 
 
 
769 aa  889    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  45.24 
 
 
766 aa  635    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  46.27 
 
 
754 aa  641    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2989  malic enzyme  54.52 
 
 
758 aa  792    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210734  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0093  malic enzyme  64.85 
 
 
769 aa  976    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1424  malic enzyme  65.38 
 
 
771 aa  985    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2337  malic enzyme  56.61 
 
 
769 aa  806    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  67.02 
 
 
767 aa  1010    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4858  malic enzyme  63.35 
 
 
772 aa  933    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633507  normal  0.0500953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  88.7 
 
 
760 aa  1378    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0557  malic enzyme  64.07 
 
 
779 aa  977    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3355  malic enzyme  64.28 
 
 
772 aa  976    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0622  malic enzyme  58.26 
 
 
777 aa  863    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0117628  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2946  malic enzyme  56.82 
 
 
769 aa  799    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.542462  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1256  malic enzyme  64.95 
 
 
769 aa  971    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2110  malic enzyme  58.82 
 
 
765 aa  859    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  58.9 
 
 
777 aa  910    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  67.69 
 
 
773 aa  1043    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3046  malic enzyme  63.85 
 
 
774 aa  931    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.472837  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1573  malic enzyme  52.66 
 
 
759 aa  784    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1558  malic enzyme  58.5 
 
 
770 aa  842    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0734911  normal  0.266658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  47.06 
 
 
754 aa  636    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0148  malic enzyme  64.77 
 
 
785 aa  970    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  95.77 
 
 
756 aa  1483    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  47.47 
 
 
760 aa  654    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1904  malic enzyme  52.9 
 
 
755 aa  753    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.894987  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1536  malic enzyme  60.56 
 
 
770 aa  864    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  44.99 
 
 
764 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  49.14 
 
 
757 aa  687    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  60.03 
 
 
755 aa  874    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0246  malic enzyme  55.34 
 
 
759 aa  821    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  95.11 
 
 
756 aa  1467    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  62.45 
 
 
776 aa  973    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  60.93 
 
 
764 aa  952    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  47.67 
 
 
773 aa  659    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  47.85 
 
 
761 aa  657    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  97.18 
 
 
756 aa  1483    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0532  malic enzyme  64.5 
 
 
766 aa  971    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4462  malic enzyme  62.27 
 
 
766 aa  939    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668544  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3476  malic enzyme  64.95 
 
 
769 aa  973    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  95.77 
 
 
756 aa  1483    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0631  malic enzyme  64.77 
 
 
785 aa  970    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3496  malic enzyme  62.14 
 
 
766 aa  939    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  50.07 
 
 
757 aa  687    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  95.11 
 
 
756 aa  1467    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>