85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3110 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3110  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 143 aa  278  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.778579 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1141  FxsA cytoplasmic membrane protein  47.18 
 
 		 168 aa  110  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123046 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  29.08 
 
 		 169 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  29.94 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  30.2 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  25.32 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  28.29 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.21 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.91 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.57 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.55 
 
 		 196 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.7 
 
 		 217 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  33.01 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  31.58 
 
 		 129 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.21 
 
 		 215 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.03 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  31.58 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  27.21 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  27.21 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.93 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  32.04 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.35 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.3 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  31.68 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.65 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.39 
 
 		 202 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.39 
 
 		 202 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.39 
 
 		 202 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.39 
 
 		 202 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  30.09 
 
 		 129 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  30.09 
 
 		 129 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  30.09 
 
 		 129 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  30.09 
 
 		 129 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  31.07 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.19 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  30.48 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.93 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2483  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.86 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.79 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  31.68 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.78 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  31.68 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  31.68 
 
 		 200 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.54 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  34.26 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  24.79 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  34.26 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  34.26 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  34.26 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  34.26 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  36 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.36 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  26.32 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.61 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4267  FxsA  28.03 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2705  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.35 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.03406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.46 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.61 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4503  FxsA  38.14 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329001  decreased coverage  0.000252852 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.7 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  25.66 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0008  hypothetical protein  36.96 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  28 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  31.03 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  27 
 
 		 172 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.09 
 
 		 154 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  28.05 
 
 		 96 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  28 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3715  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.03 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.87 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4609  FxsA  32.46 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432194  normal  0.600048 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4695  FxsA  33.33 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03972  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4669  FxsA  33.33 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3872  FxsA  33.33 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04010  inner membrane protein  33.33 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4381  FxsA  33.33 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3852  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  27.18 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.27 
 
 		 197 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.49 
 
 		 206 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  32.53 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.49 
 
 		 206 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2675  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 159 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546891  normal  0.675793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.49 
 
 		 206 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>