44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2739 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2739  HPr kinase  100 
 
 
152 aa  296  8e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.192127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  45.4 
 
 
186 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  45.26 
 
 
152 aa  91.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  49.63 
 
 
179 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  48.09 
 
 
175 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  47.41 
 
 
175 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  45.61 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  43.09 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  37.12 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  42.86 
 
 
180 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  38.52 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  42.48 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  35.9 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  37.98 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4294  HPr kinase  36.36 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  36.15 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  34.88 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  39.06 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  37.7 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  40.16 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  37.04 
 
 
168 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  40.16 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  37.59 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  37.01 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  37.01 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  41.86 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  40 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  41.77 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3573  HPr kinase  35.59 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  38.32 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  38.32 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3087  HPr kinase  37.86 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198917  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  35.71 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  35.77 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  40.51 
 
 
313 aa  50.4  0.000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  28.06 
 
 
311 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  33.33 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl062  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 
310 aa  43.9  0.0009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  29.2 
 
 
309 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  37.1 
 
 
144 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1903  HPr kinase  35.04 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.806436  normal  0.279054 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1208  HPr kinase/phosphorylase  35.16 
 
 
192 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0757  HPr kinase/phosphorylase  35.16 
 
 
192 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.825604  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  32.18 
 
 
320 aa  40.4  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>