25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2671 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2671  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  715    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00889108  normal  0.143811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  51.89 
 
 		 719 aa  322  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2712  hypothetical protein  48 
 
 		 419 aa  306  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0215  hypothetical protein  41.55 
 
 		 445 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.203001  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0820  ATPase  33.96 
 
 		 743 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3116  hypothetical protein  29.03 
 
 		 841 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4165  hypothetical protein  29.45 
 
 		 842 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0791  ATPase-like protein  26.36 
 
 		 667 aa  69.3  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1677  hypothetical protein  26.76 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  26.59 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15380  replicative helicase, RepA  27.65 
 
 		 292 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.83585e-16  unclonable  1.14965e-21 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004338  putative DNA helicase  26.97 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1825  putative DNA helicase  25.45 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4259  putative DNA helicase  25.45 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1724  putative DNA helicase  25.1 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5005  putative DNA helicase  25.61 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.386119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3697  TOPRIM  24.66 
 
 		 512 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4351  hypothetical protein  23.85 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2031  ATPase-like protein  26.63 
 
 		 621 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2969  hypothetical protein  26.23 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  24.71 
 
 		 712 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  24.33 
 
 		 712 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  24.71 
 
 		 712 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  24.71 
 
 		 712 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3156  hypothetical protein  23.37 
 
 		 640 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>