47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2165 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 65 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  64.62 
 
 		 65 aa  87  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  50.77 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.77 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3651  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.92 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  44.62 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.23 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.31 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.77 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.98 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  43.08 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.98 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0283  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.15 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0040  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0021  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71048  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.71 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1933  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.1 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.93 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0798  putative ThiS sulfur transfer protein  40.74 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1459  hypothetical protein  30.3 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0252  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.78 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 		 64 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.42 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1455  hypothetical protein  37.88 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.282408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 70 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>