More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1422 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1422  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
366 aa  757    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.482848  normal  0.726821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  55.92 
 
 
365 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.02 
 
 
366 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.22 
 
 
472 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.91 
 
 
353 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
354 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.38 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1214  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.12 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.84 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.93 
 
 
340 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0540093  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0988  regulatory protein CII  26.32 
 
 
343 aa  106  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.42 
 
 
330 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 
443 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.18 
 
 
353 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3667  regulatory protein CII  25.54 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2369  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.73 
 
 
342 aa  86.7  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.54 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  28.45 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.86 
 
 
350 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.97 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.49 
 
 
255 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  27.51 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.33 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0435  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.96 
 
 
279 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.21 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.23 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.11 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.36 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  26.36 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  24.55 
 
 
255 aa  68.9  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.13 
 
 
322 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2181  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.58 
 
 
306 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000966803  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.81 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  25.68 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  27.15 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.31 
 
 
253 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.15 
 
 
253 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.15 
 
 
253 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.15 
 
 
253 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  27.15 
 
 
253 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.15 
 
 
253 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.15 
 
 
253 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.15 
 
 
253 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 
253 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  27.15 
 
 
253 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  27.75 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3749  hypothetical protein  31.4 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.54 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.89 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  25.82 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  24.89 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.93 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.75 
 
 
272 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  25.99 
 
 
255 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.53 
 
 
309 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.92 
 
 
255 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.62 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4883  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.85 
 
 
258 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.76 
 
 
252 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.51 
 
 
300 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.03 
 
 
254 aa  64.3  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.09 
 
 
262 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.2 
 
 
329 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.22 
 
 
272 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.33 
 
 
255 aa  63.9  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.1 
 
 
313 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  26.99 
 
 
258 aa  63.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  25 
 
 
279 aa  63.9  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.89 
 
 
255 aa  63.5  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  24.66 
 
 
253 aa  63.5  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  29.38 
 
 
370 aa  63.5  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0058  putative ParA chromosome partitioning protein  28.57 
 
 
265 aa  63.2  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  25.33 
 
 
256 aa  63.2  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.45 
 
 
261 aa  63.2  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  29.27 
 
 
332 aa  63.2  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  26.47 
 
 
314 aa  63.2  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  24.03 
 
 
254 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  24.09 
 
 
260 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_011736  BbuZS7_R32  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  24 
 
 
251 aa  63.2  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00448287  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  27.62 
 
 
262 aa  62.8  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
256 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  24.7 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  29.17 
 
 
348 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  28.24 
 
 
259 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3388  hypothetical protein  25.9 
 
 
329 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853943  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.05 
 
 
407 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.76 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  26.07 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.03 
 
 
253 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.9 
 
 
254 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  25.11 
 
 
257 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3786  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.7 
 
 
255 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116138  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.9 
 
 
408 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.01 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.32 
 
 
263 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>