More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4883 on replicon NC_013442
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013442  Gbro_4883  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
258 aa  524  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4295  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.99 
 
 
265 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4176  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.85 
 
 
256 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.92 
 
 
278 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  36.86 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  38.96 
 
 
276 aa  135  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  38.33 
 
 
268 aa  135  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  37.71 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.25 
 
 
270 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  36.15 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  35.51 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.22 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  35.93 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  35.51 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.08 
 
 
269 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27233  normal  0.241063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  34.62 
 
 
253 aa  125  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.76 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.8 
 
 
257 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.18 
 
 
274 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  34.18 
 
 
274 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.69 
 
 
264 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.89 
 
 
253 aa  123  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.1 
 
 
264 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  35.04 
 
 
265 aa  122  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15550  chromosome partitioning ATPase  35.91 
 
 
263 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.38 
 
 
317 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.8 
 
 
260 aa  122  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  31.33 
 
 
257 aa  122  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  33.88 
 
 
253 aa  121  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  37.3 
 
 
259 aa  121  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.02 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  33.83 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4710  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.59 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.69 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.32 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  33.83 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.29 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.37 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.17 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.29 
 
 
268 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
257 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  35.34 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  32.18 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  35 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.98 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.83 
 
 
262 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  35.55 
 
 
261 aa  118  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  35.04 
 
 
254 aa  118  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.95 
 
 
286 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.4 
 
 
269 aa  118  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.01 
 
 
293 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18290  chromosome partitioning ATPase  35.74 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.22 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.19 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.25 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  31.8 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.59 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.21 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  35.89 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.45 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1882  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 
254 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0348907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.2 
 
 
289 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 
262 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.75 
 
 
284 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.33 
 
 
284 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.32 
 
 
284 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4190  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.41 
 
 
274 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.48 
 
 
254 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.46 
 
 
254 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  36.82 
 
 
323 aa  115  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  34.63 
 
 
273 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.14 
 
 
299 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.19 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.05 
 
 
265 aa  115  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.33 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.97 
 
 
298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  33.46 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.26 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.9 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.61 
 
 
282 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  36.73 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3210  chromosome segregation ATPase  35.93 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  32.95 
 
 
257 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.56 
 
 
253 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.56 
 
 
253 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  32.56 
 
 
253 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.56 
 
 
253 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.56 
 
 
253 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.48 
 
 
253 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.56 
 
 
253 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.56 
 
 
253 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.71 
 
 
322 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.56 
 
 
253 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  33.86 
 
 
348 aa  112  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  35.15 
 
 
262 aa  112  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.05 
 
 
265 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>