More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18290 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_18290  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
255 aa  508  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1299  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.22 
 
 
303 aa  331  8e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.987107  normal  0.450444 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1882  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.34 
 
 
254 aa  294  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0348907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.34 
 
 
269 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27233  normal  0.241063 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15550  chromosome partitioning ATPase  51.57 
 
 
263 aa  225  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.61 
 
 
278 aa  215  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  48.45 
 
 
305 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1546  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.44 
 
 
272 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1545  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.67 
 
 
278 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0482678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3091  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.4 
 
 
256 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124174  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4176  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.94 
 
 
256 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4883  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.51 
 
 
258 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4190  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.94 
 
 
274 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4295  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.94 
 
 
265 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  31.58 
 
 
370 aa  96.7  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.48 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.45 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  26.85 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  27.12 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.81 
 
 
279 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4710  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.63 
 
 
263 aa  92.4  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  30.74 
 
 
318 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.81 
 
 
290 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.08 
 
 
254 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.08 
 
 
254 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.81 
 
 
290 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  27.09 
 
 
254 aa  92  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.77 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.12 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.4 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.64 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.47 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.86 
 
 
303 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  28.29 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.56 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  27.54 
 
 
294 aa  89.4  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.76 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.08 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.08 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  27.35 
 
 
253 aa  89.4  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.84 
 
 
256 aa  89  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.53 
 
 
254 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.51 
 
 
249 aa  89  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  26.84 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  29.06 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  30.57 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3751  chromosome segregation ATPase  27.69 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626525  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.08 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 
318 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.18 
 
 
265 aa  87  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  28.33 
 
 
347 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  28.99 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.99 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  30.58 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.67 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.35 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.78 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  27.2 
 
 
333 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  25.89 
 
 
251 aa  87  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.89 
 
 
303 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  28.02 
 
 
276 aa  86.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  27.2 
 
 
335 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  30.86 
 
 
259 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  27.2 
 
 
335 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.56 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  26.18 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  30.08 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.27 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  24.79 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.21 
 
 
312 aa  86.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  28.1 
 
 
265 aa  85.9  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.35 
 
 
315 aa  85.9  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.75 
 
 
306 aa  86.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  26.38 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  27.06 
 
 
259 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 
259 aa  85.9  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.44 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  27.27 
 
 
280 aa  85.5  7e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  26.96 
 
 
264 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.34 
 
 
358 aa  85.5  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.36 
 
 
256 aa  85.5  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.33 
 
 
251 aa  85.1  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  23.73 
 
 
256 aa  85.1  9e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.83 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  28.29 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.69 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.39 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  22.22 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  26.45 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.75 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  32.47 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.77 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.84 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.94 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1796  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852765  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  25.93 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>